More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3165 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04880  two-component system sensor protein  67.55 
 
 		 537 aa  697    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3165  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 592 aa  1186    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.374256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.56 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.435386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2116  two-component system, sensor protein  60.11 
 
 		 536 aa  617  1e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60250  two-component sensor PilS  37.21 
 
 		 530 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000371089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0723  type IV pilus sensor protein PilS  35.06 
 
 		 530 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0824  sensor protein PilS  35.5 
 
 		 531 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5186  two-component sensor PilS  36.26 
 
 		 530 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0966  sensor protein PilS  37.21 
 
 		 530 aa  281  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.772393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2617  histidine kinase  38.05 
 
 		 531 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000901254  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4839  sensor protein PilS  37.58 
 
 		 529 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.82522  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 548 aa  250  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0215  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 531 aa  242  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69088 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0722  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 552 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00200947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2554  sensor protein PilS  30.89 
 
 		 528 aa  233  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  28.31 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  28.3 
 
 		 528 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2123  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.58 
 
 		 549 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0815467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 537 aa  204  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1806  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 619 aa  197  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2545  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 556 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.0765765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2270  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 548 aa  183  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0676  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 576 aa  178  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.268239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  35.2 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.2 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 531 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.290961  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0379  histidine kinase  30.74 
 
 		 694 aa  154  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0254109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1504  histidine kinase  29.55 
 
 		 587 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 572 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 566 aa  148  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  27.58 
 
 		 550 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2939  histidine kinase  29.87 
 
 		 566 aa  144  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.875107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 584 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1499  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 565 aa  140  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 568 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 582 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0959  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3217  signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 642 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.478958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.11 
 
 		 546 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1111  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 571 aa  121  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2944  sensor histidine kinase  35.8 
 
 		 705 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2643  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 678 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3053  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 679 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 581 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 525 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.44 
 
 		 752 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 525 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.46 
 
 		 747 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.46 
 
 		 747 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 526 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2808  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.17 
 
 		 682 aa  113  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561745  normal  0.251067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  36.53 
 
 		 661 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  32.04 
 
 		 611 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 680 aa  110  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 661 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0301  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 562 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.97 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.46 
 
 		 747 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.23 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  37.83 
 
 		 630 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.4 
 
 		 538 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  34.78 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  30.09 
 
 		 501 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.28 
 
 		 547 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 543 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 680 aa  107  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  35.4 
 
 		 506 aa  107  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0323  histidine kinase  36.2 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.449634  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0625173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  35.37 
 
 		 367 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  28.17 
 
 		 621 aa  104  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 615 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 571 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0184  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.57 
 
 		 555 aa  103  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  31.86 
 
 		 487 aa  103  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 502 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  29.17 
 
 		 502 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  29.89 
 
 		 363 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  26.88 
 
 		 608 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  26.65 
 
 		 622 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  26.88 
 
 		 608 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  26.88 
 
 		 608 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.14 
 
 		 1255 aa  101  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  26.88 
 
 		 608 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  33.33 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.88 
 
 		 608 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2679  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 544 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  26.88 
 
 		 608 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.7 
 
 		 457 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1225  sensor histidine kinase; sporulation kinase  28.57 
 
 		 498 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.485232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1227  sensor histidine kinase; sporulation kinase  28.57 
 
 		 498 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  30.9 
 
 		 367 aa  99.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 390 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1424  sensor histidine kinase KinD  28.57 
 
 		 498 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267919 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 549 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2630  two component sensor histidine kinase  32.88 
 
 		 555 aa  99.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>