More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1504 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1504  histidine kinase  100 
 
 		 587 aa  1176    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1499  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.81 
 
 		 565 aa  545  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.83 
 
 		 568 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134517 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.3 
 
 		 566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2939  histidine kinase  51.3 
 
 		 566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.875107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1111  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.82 
 
 		 571 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.63 
 
 		 572 aa  435  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 584 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0959  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 		 566 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3217  signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 642 aa  308  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.478958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0379  histidine kinase  38.06 
 
 		 694 aa  286  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0254109 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1806  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 619 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0215  signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 531 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 537 aa  166  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4839  sensor protein PilS  31.66 
 
 		 529 aa  161  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.82522  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.290961  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2545  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 556 aa  157  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.0765765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0723  type IV pilus sensor protein PilS  27.94 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5186  two-component sensor PilS  27.9 
 
 		 530 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60250  two-component sensor PilS  28.05 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000371089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3165  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 592 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.374256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 548 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 678 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0824  sensor protein PilS  27.39 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1537  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0966  sensor protein PilS  28.37 
 
 		 530 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.772393 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2270  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 548 aa  140  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  25.05 
 
 		 528 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  24.86 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0722  signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 552 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00200947  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2944  sensor histidine kinase  33.12 
 
 		 705 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549384  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2116  two-component system, sensor protein  29.52 
 
 		 536 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2617  histidine kinase  29.62 
 
 		 531 aa  135  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000901254  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 555 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.435386  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2123  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.67 
 
 		 549 aa  133  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0815467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0676  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 576 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.268239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3053  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 679 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2643  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 679 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04880  two-component system sensor protein  28.16 
 
 		 537 aa  127  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457628  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2808  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.86 
 
 		 682 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561745  normal  0.251067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  29.44 
 
 		 530 aa  118  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.44 
 
 		 530 aa  118  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2554  sensor protein PilS  24.89 
 
 		 528 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  25.51 
 
 		 550 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.53 
 
 		 538 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 564 aa  101  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 516 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  31.94 
 
 		 367 aa  97.8  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3109  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 448 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.98 
 
 		 571 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 559 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  24.1 
 
 		 363 aa  95.5  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.68 
 
 		 539 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 540 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.01 
 
 		 929 aa  94.4  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  30.33 
 
 		 481 aa  93.6  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 852 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0073  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 505 aa  92.8  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 548 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 372 aa  91.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 582 aa  91.3  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 548 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 469 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2759  two component sensor histidine kinase  25.4 
 
 		 764 aa  90.9  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000152723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  28.51 
 
 		 548 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 677 aa  90.5  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 855 aa  90.5  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 867 aa  89.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 488 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 885 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2679  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.42 
 
 		 544 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 367 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.05 
 
 		 369 aa  90.1  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  29.5 
 
 		 852 aa  89  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  30.49 
 
 		 490 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.32 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0078  histidine kinase  29.91 
 
 		 475 aa  89.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 520 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 656 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  27.47 
 
 		 656 aa  88.6  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  28.63 
 
 		 531 aa  88.2  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  27.4 
 
 		 983 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 523 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  26.69 
 
 		 983 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 523 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 498 aa  87.4  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 655 aa  87.4  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.38 
 
 		 579 aa  87  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 510 aa  87  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.02 
 
 		 1079 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  29.19 
 
 		 498 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 577 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0903  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 898 aa  86.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345455  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 655 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.69 
 
 		 594 aa  85.9  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3303  histidine kinase  27.57 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.51 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.45 
 
 		 731 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>