More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2116 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2116  two-component system, sensor protein  100 
 
 		 536 aa  1083    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.25 
 
 		 555 aa  1074    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.435386  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04880  two-component system sensor protein  64.84 
 
 		 537 aa  646    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3165  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.11 
 
 		 592 aa  605  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.374256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60250  two-component sensor PilS  38.02 
 
 		 530 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000371089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5186  two-component sensor PilS  37.45 
 
 		 530 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0824  sensor protein PilS  35.23 
 
 		 531 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0723  type IV pilus sensor protein PilS  34.97 
 
 		 530 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0966  sensor protein PilS  37.39 
 
 		 530 aa  270  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.772393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4839  sensor protein PilS  36.89 
 
 		 529 aa  266  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.82522  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0722  signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 		 552 aa  262  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00200947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2617  histidine kinase  42.21 
 
 		 531 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000901254  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 548 aa  256  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2554  sensor protein PilS  32.75 
 
 		 528 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2123  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.5 
 
 		 549 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0815467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0215  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 531 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69088 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  29.71 
 
 		 528 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  29.51 
 
 		 528 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1806  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 619 aa  202  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 537 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2545  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 556 aa  200  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.0765765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2270  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 548 aa  189  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.35 
 
 		 530 aa  178  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  31.35 
 
 		 530 aa  178  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0676  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 576 aa  167  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.268239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 531 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.290961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  28.02 
 
 		 550 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0379  histidine kinase  28.85 
 
 		 694 aa  140  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0254109 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.02 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1504  histidine kinase  29.52 
 
 		 587 aa  134  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.54 
 
 		 491 aa  133  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 566 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2939  histidine kinase  28.5 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.875107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0959  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 584 aa  127  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 572 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1499  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2643  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 679 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.14 
 
 		 547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  36.24 
 
 		 369 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 568 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 559 aa  120  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 364 aa  120  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1111  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 571 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  28.68 
 
 		 712 aa  118  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3053  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 679 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 678 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2944  sensor histidine kinase  32.52 
 
 		 705 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2808  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.91 
 
 		 682 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561745  normal  0.251067 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3217  signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 642 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.478958 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 525 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 		 747 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.18 
 
 		 752 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.06 
 
 		 1255 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.94 
 
 		 747 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 571 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.54 
 
 		 747 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 729 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 543 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0852  histidine kinase  33.19 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.152084  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  28.53 
 
 		 621 aa  105  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 680 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.13 
 
 		 539 aa  104  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  29.58 
 
 		 363 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0184  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.45 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 495 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  31.56 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 661 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2679  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 		 544 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.51 
 
 		 598 aa  101  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  26.36 
 
 		 608 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  27.48 
 
 		 622 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  26.36 
 
 		 608 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  26.36 
 
 		 608 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.36 
 
 		 608 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  26.36 
 
 		 608 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0884  histidine kinase  33.9 
 
 		 454 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.456358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  29.58 
 
 		 830 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 985 aa  99.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 832 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 422 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  26.36 
 
 		 608 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.12 
 
 		 578 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  31.14 
 
 		 367 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 367 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  29.44 
 
 		 501 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 736 aa  98.6  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 738 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.62 
 
 		 362 aa  97.8  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  32.6 
 
 		 630 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.03 
 
 		 538 aa  97.4  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 581 aa  97.4  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  32.73 
 
 		 419 aa  97.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 479 aa  97.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>