More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08200 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  100 
 
 		 322 aa  631  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  56.23 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  43.27 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  41.27 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  43.79 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  41.35 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  39.68 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  37.29 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  27.76 
 
 		 374 aa  115  7.999999999999999e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  30 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  29.25 
 
 		 338 aa  99.4  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  28.08 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  28.57 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  27.95 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  28.06 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  27.95 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  28.06 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  28.06 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  28.71 
 
 		 321 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 325 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  28.71 
 
 		 321 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  28.71 
 
 		 321 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  28.71 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  28.38 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  25.56 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  32.92 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  28.22 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2308  ribokinase  33.23 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.0234698 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  27.42 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.52 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29.64 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  26.03 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  28.71 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  30.89 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  25.95 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  29.89 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.03 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  27.95 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  25.28 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  28.72 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  28.14 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  28.71 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  23.22 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  31.82 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  24.24 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  23.91 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  26.85 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  28.16 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  27.97 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  26.05 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  27.92 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  25 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  27.92 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  30.43 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  25.09 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  27.92 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  27.02 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  27.87 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  25.64 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  29.79 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  27.53 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  28.66 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  25.57 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  37.89 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  27.65 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  25.73 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  29.72 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  28.25 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.64 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  25.55 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  30.47 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  27.46 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  22.54 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  28.91 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  28.68 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  24.92 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  29.36 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  25.18 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  29.43 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  26.96 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  27.99 
 
 		 306 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  28.32 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  27.47 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2877  ribokinase-like domain-containing protein  31.96 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  29.45 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  26.47 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  28.72 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  28.38 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  28.62 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  26.03 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  24.41 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.08 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  27.05 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  31.82 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  23.32 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.28 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>