More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3608 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  100 
 
 		 312 aa  629  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  39.87 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  40.72 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  38.78 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  38.78 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  38.78 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  38.78 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  38.44 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  39.8 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  38.54 
 
 		 321 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  39.46 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  38.44 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  38.1 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  38.1 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  38.1 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  38.1 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  31.42 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  30.21 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  29.31 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  31.07 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  32.54 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  32.69 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  30.2 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  30.19 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  29.48 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  26.09 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  23.5 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  28.16 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  30.8 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  24.61 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  26.03 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  28.47 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  27.08 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  27 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.96 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  26.9 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  26.78 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  27 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  28.19 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  27.83 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  31.06 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  27.83 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  27.76 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  23.1 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10546  predicted protein  28.34 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  28.99 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  35.14 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  25.71 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  25.91 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  26.03 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  28.66 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  26.82 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  26.13 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  25.74 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  28.25 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  26.98 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  22.59 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  22.59 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  42.02 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  27.27 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  24.79 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  27.27 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  28.14 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  27.27 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  27.69 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  25.68 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  23.08 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  27.74 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  26.62 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  24.76 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  26.97 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  26.76 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  26.56 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  27.44 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  25 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  23.34 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.44 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.44 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.44 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.44 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  27.09 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  23 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  25.85 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  27.57 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.44 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3132  ribokinase-like domain-containing protein  30.06 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.44 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  25.33 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  28 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  29.32 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.44 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  26.21 
 
 		 304 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  28.66 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  29.08 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  25.51 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  26.41 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  25 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  25.51 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0751  rfaE bifunctional protein  31.25 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.87 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>