More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  100 
 
 		 316 aa  616  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  49.84 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  50.63 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  45.31 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  46.1 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  43.95 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  43.27 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  41.58 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  32.87 
 
 		 374 aa  169  8e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  29.71 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  29.71 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  29.13 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  29.13 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  29.93 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  29.13 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  29.13 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  28.09 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  28.57 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  28.75 
 
 		 321 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  28.43 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  28.43 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  28.48 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  28.43 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  27.8 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  28.1 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  34.37 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  31.39 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  34.37 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  33.97 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  25.89 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  24.83 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  34.08 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  33.76 
 
 		 308 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  31.66 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  34.16 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  33.96 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  33.96 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  30.49 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  30.89 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  29.06 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  31.96 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  20.41 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  30.58 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  31.44 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  26.61 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  28.16 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  30.18 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  31.16 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.62 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  25.39 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  31.46 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  31.52 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  32.7 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  34.31 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  31.52 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  31.52 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  30.35 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  27.62 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  29.49 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  26.52 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  29.26 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  29.62 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0624  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311973 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  28.21 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  29.5 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  28.85 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  28.66 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  30.56 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  28.44 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  23.49 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  29.03 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  28.35 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  32.19 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  28.37 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  29.03 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  28.48 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  26.28 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  28.71 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  26.54 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  31.52 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  25.55 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  29.37 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  27.91 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  28.43 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  28.35 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  29.37 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  26.14 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  28.76 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  30.16 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  30.77 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  28.43 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  28.43 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  29.07 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  29.56 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.19 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  27.59 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  32.05 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>