More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2380 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  99.38 
 
 
321 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  100 
 
 
321 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  98.44 
 
 
321 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  99.07 
 
 
321 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  99.38 
 
 
321 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  76.95 
 
 
321 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  77.26 
 
 
321 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  77.57 
 
 
321 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  77.26 
 
 
321 aa  484  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  77.26 
 
 
321 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  77.26 
 
 
321 aa  484  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  76.95 
 
 
321 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.964628 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  75.7 
 
 
316 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  68.31 
 
 
325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  65.54 
 
 
325 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  38.21 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  30.67 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  29.86 
 
 
291 aa  162  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  33.22 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  33.9 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  33.33 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  29.13 
 
 
316 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  32.25 
 
 
308 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  30.12 
 
 
306 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  30.86 
 
 
306 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  26.8 
 
 
338 aa  91.7  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  24.64 
 
 
374 aa  91.3  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  30.36 
 
 
327 aa  89.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  28.52 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  22.01 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  27.31 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.14 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  25.38 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.92 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  25.38 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  28.96 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  25.32 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  26.28 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  25.44 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  27.68 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  26.57 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  24.58 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  22.89 
 
 
335 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  24.58 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  26.8 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.3 
 
 
305 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  24.32 
 
 
313 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  27.18 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  23.97 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  26.09 
 
 
312 aa  62.8  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  26.09 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  19.73 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  26.09 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  26.09 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  26.09 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  26.09 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  25.28 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  24.83 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  26.09 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  26.09 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  26.09 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  25.36 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 
398 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  22.89 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  23.6 
 
 
370 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  25.63 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  26.33 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  25.63 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  24.19 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.54 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  25.63 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  25.63 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  25.63 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  26.32 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  25.99 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  29.56 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.86 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  25.62 
 
 
628 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  24.52 
 
 
628 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  23.83 
 
 
313 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.54 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.54 
 
 
315 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  25 
 
 
312 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  26.71 
 
 
313 aa  59.3  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  25.59 
 
 
334 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  26.35 
 
 
312 aa  59.3  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  26.35 
 
 
312 aa  59.3  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  26.35 
 
 
312 aa  59.3  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.54 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  23.57 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  22.7 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  26.16 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  22.7 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  25.99 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  23.57 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.54 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  25.27 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  25.17 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>