260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0290 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  100 
 
 		 374 aa  775    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  34.57 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  33.43 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  31.25 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  30.4 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  30.34 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  28.61 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  29.31 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  29.66 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  29.8 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  28.37 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  28.94 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  28.94 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  28.94 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  28.94 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  28.65 
 
 		 321 aa  106  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  27.17 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  28.65 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  24.56 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  25.51 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  25.51 
 
 		 321 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  26.29 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  25.51 
 
 		 321 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  25.22 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  25.51 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  33.57 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  23.6 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  24.16 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  24.23 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  24.36 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  24.65 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  26.46 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1334  putative ribokinase  26.32 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.588315 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  23.55 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  26.39 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  24.86 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  25.63 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  25.56 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  23.26 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  22.91 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  24.72 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  38.64 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  40.66 
 
 		 297 aa  67  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  24.8 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  23.89 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  25.5 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  24.23 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  21.41 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  25.14 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  26.43 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  23.25 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  24.31 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  24.23 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  25.68 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  24.32 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  25 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0624  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  22.25 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  24.65 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  24.93 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  24.43 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  38.78 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  22.47 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  24.12 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  36.73 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  25 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  24.26 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  24.66 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  24.73 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  24.73 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  23.12 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  21.91 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  23.43 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  21.91 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  25.14 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  25.28 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  23.2 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  24.79 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  23.21 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  23.2 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  26.69 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  24.84 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  22.19 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  24.03 
 
 		 306 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  38.55 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  22.82 
 
 		 307 aa  57  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  21.91 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  24.3 
 
 		 309 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3132  ribokinase-like domain-containing protein  22.41 
 
 		 308 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509823 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  22.71 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  22.54 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  21.07 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  21.07 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  24.84 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  25.77 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  21.61 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  22.97 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  23.42 
 
 		 308 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  35.85 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  24.93 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>