More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3080 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  98.13 
 
 		 321 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  98.44 
 
 		 321 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  98.13 
 
 		 321 aa  639    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  100 
 
 		 321 aa  649    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  97.82 
 
 		 321 aa  617  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  97.82 
 
 		 321 aa  618  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  97.82 
 
 		 321 aa  616  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  96.26 
 
 		 316 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  76.64 
 
 		 321 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  76.95 
 
 		 321 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  76.64 
 
 		 321 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  76.95 
 
 		 321 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  76.64 
 
 		 321 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  68.31 
 
 		 325 aa  461  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  69.54 
 
 		 325 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  39.66 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  32.99 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  33.33 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  29.76 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  32.18 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  33.89 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  33.56 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  29.71 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  30.48 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  30.88 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  31.79 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  27.51 
 
 		 374 aa  99  9e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  28.85 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  28.08 
 
 		 322 aa  92.8  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  28.73 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  28.73 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.81 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  25.25 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  24.92 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  27.69 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  24.1 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  24.84 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  22.61 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  22.26 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  25.15 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  27.1 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  28.74 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  27.71 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  25.65 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  28.34 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  27.42 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  26.14 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  26.97 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  23.08 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  28.29 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.8 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.79 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0329  ribokinase-like domain-containing protein  24.56 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.810022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  28.93 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  25.93 
 
 		 320 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  23.53 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  28.34 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  27.09 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  26.98 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  25.93 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  28.74 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  27.54 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0810  ribokinase  26.2 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  25.23 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  30.26 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  29.15 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  26.4 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  27.74 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  25.5 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  25.25 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  26.14 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  22.18 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  26.01 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  24.92 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  28.67 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  27.9 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  25.85 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  24.62 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  24.54 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  23.96 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.5 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  25.64 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  22.67 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>