More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06080 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  100 
 
 		 303 aa  595  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  55.84 
 
 		 322 aa  311  9e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  43.95 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  45.02 
 
 		 327 aa  208  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  42.38 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  42.76 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  43.05 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  38.23 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  34.23 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  33.89 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  33.22 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  33.9 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  33.9 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  33.9 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  33.9 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  33.9 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  34.23 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  33.22 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  33.22 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  33.22 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  33 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  34.56 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  28.81 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  32.21 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  30.42 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  28.03 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  28.24 
 
 		 336 aa  96.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  29.87 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  28.67 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  24.57 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  26.78 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  29.75 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  29.45 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  26.92 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  37.93 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  29.59 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.44 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  27.62 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  26.14 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.86 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  28.89 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  28.16 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  28.2 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  29.93 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.39 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.38 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  22.53 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  25.48 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  31.68 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  27.57 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  26.3 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  25.41 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  24.6 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  27.95 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  26.22 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  30.17 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  25.58 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  25.25 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  30.45 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  29.9 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  25.93 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  25.16 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  28.34 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  30.69 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  24.54 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  28.34 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  26.3 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  29.19 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  29.19 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  26.28 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  29.19 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  29.67 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  27.45 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  29.67 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  25.1 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  25.1 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  28.35 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  28.29 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  29.67 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  29 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  29.33 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  28.21 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  30.09 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  30.09 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  29.33 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  29.33 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  28.09 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  32.61 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  30.87 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  29.33 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  29.33 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  27.62 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  29.47 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  24.82 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  28.33 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  29.47 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  26.25 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  20.13 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  28.33 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  29 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>