More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3478 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  100 
 
 		 327 aa  617  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  51.1 
 
 		 316 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  52.87 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  45.83 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  43.95 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  45.02 
 
 		 303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  44.41 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  43.38 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  29.33 
 
 		 374 aa  132  7.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  31.96 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  31.33 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  31.65 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964628 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  31.33 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  31.33 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  31.33 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  31.33 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  25.41 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  30.7 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  30.03 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  30.03 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  29.94 
 
 		 325 aa  99  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  30.92 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  31.02 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  31.58 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  24.32 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  23.43 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  31.56 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  33.95 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  27.04 
 
 		 313 aa  89.7  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  33.87 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  33.76 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  33.76 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  33.87 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  29.1 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  33.56 
 
 		 315 aa  86.3  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  23.62 
 
 		 297 aa  86.3  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  28.53 
 
 		 301 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  31.6 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1089  ribokinase family sugar kinase  29.04 
 
 		 338 aa  85.9  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0219735  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  26.18 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  25.71 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  33.33 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  31.17 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  28.66 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  30.86 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.25 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  30.56 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  29.66 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.6 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  29.36 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  31.46 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  26.98 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  35.27 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  33.22 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  33.55 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1475  ribokinase-like domain-containing protein  32.67 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  33.75 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  29.01 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  26.82 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  23.17 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  28.36 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  29.15 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  29.63 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  28.17 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  28.17 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  28.17 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.52 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  30.84 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  31.11 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  22.55 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  28.48 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  21.38 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  33.02 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  33.67 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  22.4 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  27.81 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  28.13 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2308  ribokinase  35.02 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.0234698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  29.39 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  28.72 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  28.72 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  28.39 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  30.53 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  32.55 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  28.85 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  30.3 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  30.53 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  30.53 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  32.7 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  30.53 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6187  ribokinase  35.2 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313469  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  26.97 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  30.37 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  26.3 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  25.99 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  31.86 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  25.28 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  28.72 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>