More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2877 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2877  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 284 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1216  carbohydrate kinase ribokinase family protein  96.83 
 
 		 284 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2878  PfkB  55.48 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.662908 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2308  ribokinase  56.49 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.0234698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  43.49 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1841  PfkB  45.61 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0519375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  43.84 
 
 		 327 aa  218  8.999999999999998e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  40.41 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  33.22 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  39.67 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  39.07 
 
 		 403 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  38.21 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3132  ribokinase-like domain-containing protein  41.88 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509823 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  40.74 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  34.11 
 
 		 313 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  40 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  41.5 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  40 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  40.82 
 
 		 309 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  42.71 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  41.16 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  40.82 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  38.61 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  41.81 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  34.98 
 
 		 309 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  36.03 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  41.2 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  38.74 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  40.48 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  39 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  37.91 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  40.48 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  37.54 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  34.33 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  41.64 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  35.03 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  37.54 
 
 		 307 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  42.11 
 
 		 297 aa  138  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  34.73 
 
 		 345 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  35.02 
 
 		 307 aa  138  8.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  39.73 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  32.67 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  40.77 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  35.22 
 
 		 303 aa  137  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  40.77 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  37.21 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  40.77 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  37.75 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  38.28 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  37.75 
 
 		 308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  37.75 
 
 		 308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  40.67 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  38.46 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  33.67 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  32.89 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  32.09 
 
 		 340 aa  135  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  39.46 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  38.56 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  38.41 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  39.07 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  39.07 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  39.07 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  37.09 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  39.07 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  38.74 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  37.62 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  38.74 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1858  ribokinase  39.33 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  37.29 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  37.62 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  36.25 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  38.74 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  40.28 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  36.63 
 
 		 303 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  36.07 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  40.74 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  35.67 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  38.74 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  39.33 
 
 		 324 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  37.92 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  37.16 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  39.53 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  40.54 
 
 		 305 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  39.73 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  32.78 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  38.89 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  38.78 
 
 		 318 aa  132  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  37.21 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  40.07 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  36.36 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  36.12 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  36.93 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  38.6 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  41.44 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  38.41 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  38.41 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  38.41 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  38.41 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  37.54 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  35.86 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>