More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1841 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1841  PfkB  100 
 
 
297 aa  603  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0519375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  44.18 
 
 
297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  42.81 
 
 
298 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  42.41 
 
 
327 aa  242  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  36.82 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1216  carbohydrate kinase ribokinase family protein  44.26 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2877  ribokinase-like domain-containing protein  44.93 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2308  ribokinase  44.07 
 
 
289 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.0234698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2878  PfkB  40.42 
 
 
290 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.662908 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  37.75 
 
 
317 aa  153  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  33.44 
 
 
307 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  31.29 
 
 
340 aa  149  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  34.15 
 
 
304 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  30.43 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  33.22 
 
 
313 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  37.04 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  32.77 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  35 
 
 
315 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  39.46 
 
 
309 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  35.37 
 
 
307 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  34.35 
 
 
310 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  34.01 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  37.5 
 
 
308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  35.37 
 
 
312 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  38.31 
 
 
308 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  32.78 
 
 
307 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  37.75 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  37.75 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  34.58 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  37.75 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  34.78 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  31.44 
 
 
308 aa  130  3e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  34.87 
 
 
306 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  34.72 
 
 
305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  29.14 
 
 
310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02480  ATP binding protein, putative  32.9 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  31.72 
 
 
305 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  33.78 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  33 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  34.45 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  34.45 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  34.24 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  34.3 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  36.7 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  33.89 
 
 
305 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  34.3 
 
 
308 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  33.22 
 
 
306 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  36.48 
 
 
308 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  34.3 
 
 
308 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  32.64 
 
 
403 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  35.27 
 
 
302 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  28.81 
 
 
310 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  36.18 
 
 
299 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  31.77 
 
 
298 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  34.67 
 
 
304 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  35.79 
 
 
309 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  32.99 
 
 
308 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  34.32 
 
 
302 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  33.55 
 
 
299 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  30.9 
 
 
304 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  30.9 
 
 
304 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  32.79 
 
 
424 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  37.37 
 
 
308 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  33.55 
 
 
308 aa  122  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  31.49 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  31.33 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  37.25 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  31.67 
 
 
403 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  34.81 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  32.89 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  29 
 
 
345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  34.33 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  37.24 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  37.09 
 
 
297 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  29.32 
 
 
305 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  32.11 
 
 
305 aa  119  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  35.64 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  35 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  33.9 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  38.69 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  31.86 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  34.44 
 
 
308 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  32.55 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 
308 aa  116  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  36.07 
 
 
296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  32.68 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  32.68 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  32.68 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  32.68 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  39.25 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  33.89 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  32.68 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  35.03 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  34.11 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  37.04 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  35.67 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  36.91 
 
 
307 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  34.59 
 
 
308 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  33.11 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>