More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE02480 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE02480  ATP binding protein, putative  100 
 
 		 315 aa  643    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  32.39 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  34.07 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1841  PfkB  32.9 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0519375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0465  ribokinase  32.71 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  32.83 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  31.27 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  30.5 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  31.76 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75489  ribokinase  30.99 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  31.45 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  29.79 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  32.5 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  28.8 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  31.56 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  31.38 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  33.74 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  29.06 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  28.27 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2308  ribokinase  31.7 
 
 		 289 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.0234698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  31.48 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  30.46 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  31.91 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  29.91 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  30.18 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  32.71 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  32.53 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  31.1 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0069  PfkB domain protein  31.56 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  30.79 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  30.75 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  30.06 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  31.83 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  31.25 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  31.25 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  29.52 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  29.82 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  29.82 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  29.82 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.72 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0279  PfkB domain protein  30.25 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0301345 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0671  PfkB domain protein  30 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  31.25 
 
 		 311 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  31.45 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  29.82 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  29.82 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  29.82 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  29.82 
 
 		 309 aa  99.4  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  29.82 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  32.81 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29.54 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2130  ribokinase-like domain-containing protein  28.13 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  30.43 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  31.14 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  30.19 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  29.48 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  31.46 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  29.75 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  31.55 
 
 		 307 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  29.91 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  29.91 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  29.91 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  29.23 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  29.91 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  30.46 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  29.91 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1216  carbohydrate kinase ribokinase family protein  29.11 
 
 		 284 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  29.28 
 
 		 302 aa  95.9  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  29.18 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  28.12 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  31.15 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  27.5 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  30.98 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  31.63 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  30.98 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  27.3 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  31.38 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  30.46 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  30.5 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3132  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509823 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  31.45 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  28.53 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  29.72 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  31.53 
 
 		 340 aa  92.8  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  28.53 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  28.53 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  30.16 
 
 		 321 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  30.72 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  30.5 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  30.82 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  28.09 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  26.59 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  28.09 
 
 		 285 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  30.5 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  26.59 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  28.09 
 
 		 285 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  31.13 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  30.5 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  30.5 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>