More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1090 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1090  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 255 aa  503  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0080  LacI family transcription regulator  58.55 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0183  transcriptional regulator, LacI family  57.24 
 
 		 326 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  37.82 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33130  transcriptional regulator, LacI family  47.19 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.260263  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2271  DNA-binding transcriptional repressor MalI  49.43 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.485606  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  36.72 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  47.06 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3760  LacI family transcription regulator  37.8 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0180539  normal  0.0106045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2029  transcriptional regulator, LacI family  38.93 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1861  transcriptional regulator  33.13 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  34.83 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0249  LacI family transcription regulator  37.21 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3482  Alanine racemase  46.43 
 
 		 359 aa  72.4  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  47.13 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  47.13 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  47.13 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  47.13 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  47.13 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  47.13 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  47.13 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  47.13 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 		 330 aa  72  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  47.13 
 
 		 342 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  38.32 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  43.62 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1093  LacI family transcription regulator  33.98 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  39.06 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  43.33 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.1 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  44.04 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2900  LacI family transcription regulator  31.97 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  44.04 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1564  DNA-binding transcriptional repressor MalI  45.98 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.253156 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  32.64 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0125  LacI family response repressor  32.65 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0785  DNA-binding transcriptional regulator FruR  34.97 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  32.8 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  43.68 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2426  LacI family transcription regulator  39 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0287642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.35 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3761  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.68 
 
 		 338 aa  68.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0115  transcriptional repressor  41.86 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  41.86 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  41.86 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 347 aa  68.6  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  39.86 
 
 		 350 aa  68.6  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0347  transcriptional regulator, LacI family  35.66 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  31.72 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  32.39 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.61 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4042  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.46 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  43.53 
 
 		 379 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6927  LacI family transcription regulator  36.81 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0193  transcriptional regulator, LacI family  45.88 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29660  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0874  transcriptional regulator, LacI family  36.51 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7452  LacI family transcription regulator  41.05 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.390478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  35.57 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  44.05 
 
 		 344 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1668  LacI family transcription regulator  29.09 
 
 		 335 aa  67  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4446  transcriptional regulator, LacI family  39.29 
 
 		 348 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.3 
 
 		 352 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  44.71 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  36.14 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18230  DNA-binding transcriptional regulator FruR  39.8 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0329354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.54 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1582  DNA-binding transcriptional regulator FruR  39.8 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  43.33 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3319  transcriptional regulator, LacI family  42.35 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419074  normal  0.0675752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0617  transcriptional regulator, LacI family  37.58 
 
 		 334 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  42.35 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0708  HTH-type transcriptional regulator, LacI family  39.51 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  40.7 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  42.35 
 
 		 337 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  30.13 
 
 		 339 aa  65.5  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  39.51 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12180  DNA-binding transcriptional regulator FruR  32.72 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382176  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2180  transcriptional regulator, LacI family  38.61 
 
 		 362 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000177462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1562  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35 
 
 		 345 aa  65.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0593  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 328 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1767  LacI family transcription regulator  36.13 
 
 		 370 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  36.23 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  46.99 
 
 		 344 aa  65.1  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 		 359 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1623  transcriptional regulator, LacI family  29.86 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  50 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0436  LacI family transcription regulator  44.71 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.78 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>