More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12180 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_12180  DNA-binding transcriptional regulator FruR  100 
 
 		 330 aa  655    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0785  DNA-binding transcriptional regulator FruR  75.54 
 
 		 330 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  66.46 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18230  DNA-binding transcriptional regulator FruR  66.77 
 
 		 329 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0329354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1582  DNA-binding transcriptional regulator FruR  66.46 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0953  fructose repressor FruR, putative  64.33 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0820  DNA-binding transcriptional regulator FruR  62.65 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0826  DNA-binding transcriptional regulator FruR  63.72 
 
 		 331 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0792  DNA-binding transcriptional regulator FruR  63.41 
 
 		 331 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0815  DNA-binding transcriptional regulator FruR  63.11 
 
 		 354 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4401  DNA-binding transcriptional regulator FruR  61.28 
 
 		 331 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2649  DNA-binding transcriptional regulator FruR  55.29 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000221  fructose repressor FruR LacI family  47.71 
 
 		 326 aa  296  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05957  DNA-binding transcriptional regulator FruR  46.99 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0452  DNA-binding transcriptional regulator FruR  48.77 
 
 		 326 aa  277  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0089  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.82 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3550  DNA-binding transcriptional regulator FruR  45.73 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3791  DNA-binding transcriptional regulator FruR  43.64 
 
 		 334 aa  252  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3603  DNA-binding transcriptional regulator FruR  43.33 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0750  DNA-binding transcriptional regulator FruR  44.24 
 
 		 334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0598  DNA-binding transcriptional regulator FruR  43.33 
 
 		 334 aa  242  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0636  DNA-binding transcriptional regulator FruR  43.33 
 
 		 334 aa  242  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0626  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 334 aa  241  7.999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.800956  normal  0.256043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00081  DNA-binding transcriptional dual regulator  42.73 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0085  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0088  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.936017 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3577  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00080  hypothetical protein  42.73 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0082  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0086  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0073  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3520  transcriptional regulator, LacI family  42.73 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0135  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000945493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0134  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0127  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0130  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3529  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 336 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3399  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 336 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2929  DNA-binding transcriptional regulator FruR  42.73 
 
 		 336 aa  238  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  29.2 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3916  transcriptional regulator, LacI family  29.7 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2909  sucrose operon repressor  30.77 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00007545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 337 aa  132  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2023  LacI family transcription regulator  30.38 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  32 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3759  transcriptional regulator, LacI family  30.99 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.899629  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4207  LacI family transcription regulator  30.61 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  31.54 
 
 		 346 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02609  hypothetical protein  31.27 
 
 		 332 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  30.87 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.89 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  30.33 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3596  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 		 339 aa  125  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  27.21 
 
 		 342 aa  125  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  24.77 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  30.38 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.61 
 
 		 356 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02648  L-fuculose phosphate aldolase  30.72 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  29.75 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1104  periplasmic sugar binding transcriptional regulator  30.55 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1892  transcriptional regulator, LacI family  27.62 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0874  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0347  transcriptional regulator, LacI family  29.18 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.427458  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  29.46 
 
 		 348 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0391  transcriptional regulator, LacI family  28.85 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.133972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  27.81 
 
 		 336 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  28.3 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.17 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  26.59 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  30.58 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  29.75 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1193  transcriptional regulator, LacI family  29.84 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.53 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  30.28 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  29.78 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1009  transcriptional regulator, LacI family  23.64 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2710  regulatory protein, LacI  25.9 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  29.53 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  29.19 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  28.62 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  28.12 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  27.96 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  25.17 
 
 		 338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  27.71 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  27.16 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.01 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  27.71 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  28.23 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.39 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  25.71 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  28.12 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  27.71 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  26.13 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>