More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3319 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3319  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 337 aa  656    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419074  normal  0.0675752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33130  transcriptional regulator, LacI family  72.26 
 
 		 361 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.260263  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3001  transcriptional regulator, LacI family  69.11 
 
 		 343 aa  428  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1983  transcriptional regulator, LacI family  69.91 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2344  transcriptional regulator, LacI family  63.72 
 
 		 349 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0461  transcriptional regulator, LacI family  61.06 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0366  transcriptional regulator, LacI family  60.3 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  57.88 
 
 		 347 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 340 aa  362  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  56.42 
 
 		 339 aa  361  9e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  55.49 
 
 		 344 aa  352  4e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  56.36 
 
 		 337 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1620  LacI family transcription regulator  53.47 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  49.85 
 
 		 348 aa  298  8e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  54.28 
 
 		 340 aa  296  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  53.05 
 
 		 338 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3338  transcriptional regulator, LacI family  53.05 
 
 		 341 aa  285  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.680798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4877  transcriptional regulator, LacI family  51.06 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00304627  normal  0.857214 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1873  LacI family response repressor  42.07 
 
 		 368 aa  279  6e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.845568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4933  transcriptional regulator, LacI family  50.3 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0794709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1825  transcriptional regulator, LacI family  51.05 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  44.91 
 
 		 350 aa  242  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.71 
 
 		 350 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0193  transcriptional regulator, LacI family  42.26 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0502  transcriptional regulator, LacI family  41.98 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0979375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3482  Alanine racemase  43.96 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0181  transcriptional regulator, LacI family  43.28 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  40.99 
 
 		 348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  43.07 
 
 		 351 aa  222  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0091  LacI family transcription regulator  41.62 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  40.42 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30450  transcriptional regulator  45 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158752  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  41.18 
 
 		 348 aa  202  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  38.76 
 
 		 331 aa  202  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.53 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0069  transcriptional regulator, LacI family  40.41 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.85 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  40.9 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  38.53 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.73 
 
 		 335 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  38.55 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  38.74 
 
 		 339 aa  185  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.35 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.82 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  34.31 
 
 		 342 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  39.35 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 		 348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  38.14 
 
 		 353 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  40.9 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  36.98 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  38.07 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2720  transcriptional regulator, LacI family  38.94 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.687845  normal  0.476409 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  34.13 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0113  transcriptional regulator, LacI family  39.14 
 
 		 350 aa  180  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3715  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  37.57 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.44 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.34 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  33.53 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2371  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 		 337 aa  176  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  33.33 
 
 		 331 aa  175  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  37.32 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  39.77 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1486  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.479144 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.93 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.64 
 
 		 347 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.64 
 
 		 347 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0347  transcriptional regulator, LacI family  39.48 
 
 		 347 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  31.12 
 
 		 332 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.62 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  31.12 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1329  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.315575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  30.09 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  30.82 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  30.82 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.21 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  30.82 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  35.57 
 
 		 355 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  30.82 
 
 		 332 aa  168  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  30.51 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  30.51 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35.86 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.82 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.86 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  30.51 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.82 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.34 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.16 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.85 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.16 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  29.7 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.85 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.74 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.02 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>