More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0751 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0751  putative hydrolase  100 
 
 
113 aa  219  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.31973  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  63.46 
 
 
276 aa  114  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  59.81 
 
 
281 aa  111  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  61.17 
 
 
270 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2188  alpha/beta hydrolase fold  55.75 
 
 
270 aa  100  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4389  alpha/beta hydrolase fold  59.81 
 
 
265 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  52.04 
 
 
278 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  40 
 
 
272 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 
270 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  43.33 
 
 
299 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  43.33 
 
 
299 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  42.59 
 
 
272 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  44.09 
 
 
260 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  41.11 
 
 
257 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  41.49 
 
 
351 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  41.94 
 
 
352 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  41.57 
 
 
264 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2789  alpha/beta hydrolase fold protein  45.78 
 
 
300 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  43.82 
 
 
270 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  42.55 
 
 
270 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  41.84 
 
 
276 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 
285 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 
344 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  40.43 
 
 
262 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
270 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
258 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  33.88 
 
 
295 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  43.18 
 
 
299 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  42.05 
 
 
275 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
266 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  36.63 
 
 
255 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  41.3 
 
 
356 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00980  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.24 
 
 
279 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
271 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 
270 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
251 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2223  alpha/beta hydrolase fold  42.35 
 
 
286 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  41.76 
 
 
264 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  37.62 
 
 
267 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  39.13 
 
 
272 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  40 
 
 
276 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
312 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
312 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 
258 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
312 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 
270 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5224  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
269 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164951  normal  0.667008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 
294 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  40.16 
 
 
397 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  40.71 
 
 
350 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
270 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
340 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  40.71 
 
 
344 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  37.36 
 
 
301 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 
291 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  44.55 
 
 
279 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1483  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.84 
 
 
272 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  38.3 
 
 
280 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  39.77 
 
 
271 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
303 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1784  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.84 
 
 
272 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.359602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 
274 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  36.26 
 
 
292 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 
330 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  41.57 
 
 
312 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
289 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1590  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  36.84 
 
 
272 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 
250 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 
264 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  31.09 
 
 
256 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  38.83 
 
 
387 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  35.87 
 
 
311 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 
275 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
288 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  41.98 
 
 
279 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 
290 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
294 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 
264 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 
260 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 
261 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
260 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
346 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  38.64 
 
 
270 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  33.33 
 
 
253 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
272 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
289 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 
250 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  37.36 
 
 
259 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 
307 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 
248 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  41.86 
 
 
278 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 
592 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  36.63 
 
 
270 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  37.25 
 
 
387 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 
261 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 
261 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 
270 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
308 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
255 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4462  alpha/beta hydrolase fold protein  47.06 
 
 
277 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>