More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4389 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4389  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 265 aa  520  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  86.74 
 
 		 281 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2188  alpha/beta hydrolase fold  57.41 
 
 		 270 aa  258  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  50.2 
 
 		 276 aa  218  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  41.92 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0751  putative hydrolase  59.81 
 
 		 113 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.31973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.78 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  33.46 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0961  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  26.59 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.68 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.9 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.58 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3602  Alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.183144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1435  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.458489  normal  0.862062 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2925  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.44 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  29.78 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  23.05 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.39 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.39 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  27.59 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.59 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  27.07 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3130  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5136  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  27.07 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  27.84 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0341  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  26.37 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  40.46 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.04 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.54 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.54 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.23 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4750  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111436  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4836  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  29.37 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  28.57 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  26.62 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  27.55 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  26.89 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  26.92 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  26.89 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  26.89 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  26.97 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  26.89 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2049  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  24.46 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  26.59 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13624  hydrolase  28.92 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.907e-24  hitchhiker  0.00699432 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  26.59 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>