More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13624 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13624  hydrolase  100 
 
 
257 aa  512  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.907e-24  hitchhiker  0.00699432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4750  alpha/beta hydrolase fold  76.98 
 
 
263 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111436  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4836  alpha/beta hydrolase fold  76.98 
 
 
263 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1435  alpha/beta hydrolase fold  77.38 
 
 
253 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.458489  normal  0.862062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5136  alpha/beta hydrolase fold  76.19 
 
 
263 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5351  alpha/beta hydrolase fold  76.4 
 
 
254 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0961  alpha/beta hydrolase fold protein  60.17 
 
 
284 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0587  alpha/beta hydrolase fold protein  52.63 
 
 
258 aa  228  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.9 
 
 
261 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0341  alpha/beta hydrolase fold protein  46.34 
 
 
248 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  34.66 
 
 
278 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  33.47 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2188  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
270 aa  72  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5264  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  29.74 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
307 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  26.72 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
275 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.81 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
266 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  27.61 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
280 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
266 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.11 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  26.38 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  39.25 
 
 
282 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  27.41 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  30.35 
 
 
258 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 
335 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  29.01 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  25.2 
 
 
275 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
366 aa  55.8  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  23.11 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 
456 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
259 aa  55.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
394 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  28.91 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.76 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  30.2 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
269 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
279 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 
272 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  38.18 
 
 
281 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
281 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1280  alpha/beta fold family hydrolase  34.26 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022197  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  27.09 
 
 
275 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 
295 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  24.25 
 
 
253 aa  52  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 
250 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.67 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.09 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  24.03 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  25.46 
 
 
259 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4389  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
265 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
294 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 
329 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  22.66 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>