More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0467 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0467  formylmethionine deformylase  100 
 
 		 161 aa  329  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2579  peptide deformylase  52.17 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.231026  hitchhiker  0.00000660539 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  42.31 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  43.12 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  42.58 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  42.58 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  39.88 
 
 		 180 aa  120  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  40.26 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  39.35 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  39.35 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  39.35 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  37.79 
 
 		 193 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  45.38 
 
 		 201 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  45.38 
 
 		 201 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  45.38 
 
 		 201 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  43.79 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  39.35 
 
 		 172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  40.65 
 
 		 176 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  40 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  38.71 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  39.35 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  40.26 
 
 		 177 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  38.71 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  40.26 
 
 		 177 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  38.71 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0149  peptide deformylase  44.59 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.213769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0873  N-formylmethionyl tRNA deformylase  43.31 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  38.61 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  39.87 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2533  peptide deformylase  42.68 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.123304  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  43.7 
 
 		 203 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  39.35 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  39.24 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  39.35 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  39.31 
 
 		 202 aa  113  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  39.31 
 
 		 202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  39.24 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  35.63 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0646  peptide deformylase  46.26 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  40.88 
 
 		 173 aa  110  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  41.72 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  39.75 
 
 		 167 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  40.99 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  39.13 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  37.5 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  41.53 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  42.86 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  41.56 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0868  peptide deformylase  35.62 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.184037 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  40.4 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  42.86 
 
 		 201 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  38.06 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  39.1 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  37.42 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  38.06 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  38.06 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  35.19 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  38.06 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38.71 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  41.06 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  40.25 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  38.71 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  35.22 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  40.51 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  104  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  39.23 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  39.13 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  36.71 
 
 		 172 aa  104  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  38.06 
 
 		 168 aa  103  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  35.85 
 
 		 187 aa  103  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  41.29 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  38.06 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  37.74 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  38.99 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  39.02 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0898  peptide deformylase  43.18 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0392  peptide deformylase  32.74 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  36.31 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  37.25 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  38.65 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  36.88 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  36.88 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  39.07 
 
 		 184 aa  101  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  42.58 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1713  peptide deformylase  36.31 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  40.38 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  40.26 
 
 		 184 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  34.44 
 
 		 175 aa  100  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  36.77 
 
 		 168 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  40.34 
 
 		 187 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  41.1 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  38.46 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  38.46 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  37.74 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  36.77 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4749  peptide deformylase  37.42 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  38.75 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  39.62 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  38.41 
 
 		 172 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>