More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0535 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0535  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 609 aa  1180    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  39.68 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  39.68 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  39.68 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  42.2 
 
 		 160 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  42.2 
 
 		 160 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  42.2 
 
 		 160 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  42.2 
 
 		 160 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  42.2 
 
 		 160 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  45.16 
 
 		 152 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  42.2 
 
 		 160 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  42.2 
 
 		 160 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3029  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.05 
 
 		 721 aa  67.8  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000283556  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3588  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.6 
 
 		 746 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2410  RNA binding S1 domain protein  41.46 
 
 		 795 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367587  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  43.33 
 
 		 124 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2459  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.68 
 
 		 710 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00423347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  48 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  42.22 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  45.21 
 
 		 133 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  45.21 
 
 		 133 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  43.84 
 
 		 133 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  45.92 
 
 		 757 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  39.58 
 
 		 686 aa  62.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2875  RNA binding S1 domain protein  41.67 
 
 		 791 aa  61.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  39.33 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.67 
 
 		 755 aa  60.8  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3629  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  46.91 
 
 		 717 aa  60.8  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  45.21 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0013  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.59 
 
 		 713 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1012  tex protein, putative  30.05 
 
 		 817 aa  60.1  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2537  RNA binding S1  41.67 
 
 		 803 aa  60.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1997  Resolvase RNase H domain protein  43.56 
 
 		 798 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0478304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3845  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.68 
 
 		 712 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3658  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.68 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3548  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.68 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3566  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.68 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276153  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3944  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.68 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3905  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.68 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  47.37 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3854  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.68 
 
 		 712 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.68 
 
 		 712 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0729219 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0448  RNA-binding protein  35.63 
 
 		 121 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.308089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  47.37 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.02 
 
 		 126 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0949  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.08 
 
 		 747 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1207  30S ribosomal protein S1  38.24 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  36.03 
 
 		 730 aa  58.5  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  47.5 
 
 		 761 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1314  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.7 
 
 		 772 aa  58.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.122367  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3421  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.39 
 
 		 788 aa  57.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.507063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  46.05 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2844  Tex-like protein protein-like protein  38.69 
 
 		 815 aa  57.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142606  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1707  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.57 
 
 		 798 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.700604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.5 
 
 		 798 aa  57.4  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  40.24 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1792  putative transcription accessory protein  41.67 
 
 		 793 aa  57.4  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781108  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0324  hypothetical protein  35.79 
 
 		 124 aa  56.2  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  43.68 
 
 		 488 aa  57  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1986  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  39.51 
 
 		 708 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00363303  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3818  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.44 
 
 		 712 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.79465e-59 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.88 
 
 		 503 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  39.09 
 
 		 772 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  43.53 
 
 		 496 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  42.67 
 
 		 705 aa  57  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  46.05 
 
 		 491 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  46.05 
 
 		 491 aa  57  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  42.35 
 
 		 485 aa  57  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1942  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.6 
 
 		 778 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.14 
 
 		 514 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2053  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.14 
 
 		 723 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  34.27 
 
 		 788 aa  56.2  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  37.5 
 
 		 120 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1854  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  39.51 
 
 		 716 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2668  RNA binding S1 domain-containing protein  35.38 
 
 		 783 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.51511 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  52.78 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.82 
 
 		 774 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1789  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  41.25 
 
 		 733 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  37.07 
 
 		 779 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1862  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.6 
 
 		 827 aa  55.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0217  RNA binding S1  37.65 
 
 		 864 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  44 
 
 		 529 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  46.67 
 
 		 787 aa  55.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  43.21 
 
 		 597 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0895  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.55 
 
 		 861 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  44 
 
 		 487 aa  55.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  38.98 
 
 		 779 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  35.9 
 
 		 539 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1786  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.05 
 
 		 717 aa  55.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.062273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3880  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.63 
 
 		 777 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34820  transcriptional accessory protein  36.05 
 
 		 816 aa  55.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_843  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  40.26 
 
 		 720 aa  55.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.946894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.75 
 
 		 787 aa  55.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  42.35 
 
 		 492 aa  55.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  37.7 
 
 		 775 aa  54.7  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00520  RNA binding S1 domain protein  39.76 
 
 		 124 aa  54.7  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.85433e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.98 
 
 		 712 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  44.33 
 
 		 801 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1193  RNA binding S1 domain protein  35.42 
 
 		 500 aa  54.3  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000667111  hitchhiker  0.00401101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  40.82 
 
 		 759 aa  54.3  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>