More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1027 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1027  DNA topoisomerase type IA central domain protein  100 
 
 		 775 aa  1580    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0839  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  42.66 
 
 		 681 aa  515  1e-144  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0618738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4786  DNA topoisomerase III  35.38 
 
 		 729 aa  335  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000176541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  35.61 
 
 		 697 aa  333  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2001  DNA topoisomerase III  34.8 
 
 		 721 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0468853  normal  0.227685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  35.32 
 
 		 695 aa  327  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  33.29 
 
 		 701 aa  327  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1814  DNA topoisomerase III  33.88 
 
 		 746 aa  326  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000049095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3176  DNA topoisomerase III  31.59 
 
 		 873 aa  326  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1760  DNA topoisomerase III  33.84 
 
 		 731 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1489  DNA topoisomerase III  33.71 
 
 		 731 aa  324  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0497  DNA topoisomerase  34.23 
 
 		 686 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.167665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0922  DNA topoisomerase III  34.25 
 
 		 722 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1318  DNA topoisomerase III  30.48 
 
 		 805 aa  312  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000791242  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6481  DNA topoisomerase III  33.47 
 
 		 865 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.987815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3127  DNA topoisomerase III  33 
 
 		 865 aa  310  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588519  normal  0.127052 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3146  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 		 865 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186369  normal  0.583492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3068  DNA topoisomerase III  33.05 
 
 		 865 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2517  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 		 865 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3130  DNA topoisomerase III  33.33 
 
 		 865 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0356  DNA topoisomerase III  33.8 
 
 		 729 aa  308  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2281  DNA topoisomerase III  33.09 
 
 		 711 aa  308  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00290966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2322  DNA topoisomerase III  33.09 
 
 		 711 aa  308  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0191867  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3185  DNA topoisomerase III  32.91 
 
 		 865 aa  308  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4887  DNA topoisomerase III  33.43 
 
 		 729 aa  306  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0485  DNA topoisomerase III  33.99 
 
 		 729 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0361  DNA topoisomerase III  33.99 
 
 		 729 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0351  DNA topoisomerase III  33.99 
 
 		 729 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0375  DNA topoisomerase III  33.99 
 
 		 729 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0358  DNA topoisomerase III  34.35 
 
 		 729 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0418  DNA topoisomerase III  33.99 
 
 		 729 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0347  DNA topoisomerase III  33.99 
 
 		 729 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0032  DNA topoisomerase III  33.43 
 
 		 908 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0306  DNA topoisomerase III  33.52 
 
 		 889 aa  303  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3223  DNA topoisomerase III  34.17 
 
 		 730 aa  301  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0125  DNA topoisomerase III  32.81 
 
 		 891 aa  301  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3569  DNA topoisomerase III  32.76 
 
 		 891 aa  301  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4419  DNA topoisomerase III  33.24 
 
 		 888 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0873603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1451  DNA topoisomerase III  31.53 
 
 		 620 aa  300  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000215899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0155  DNA topoisomerase III  32.95 
 
 		 906 aa  300  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4627  DNA topoisomerase III  33.29 
 
 		 982 aa  300  9e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.957836  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0139  DNA topoisomerase III  32.81 
 
 		 869 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.968276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0343  DNA topoisomerase III  32.81 
 
 		 869 aa  300  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2271  DNA topoisomerase III  32.81 
 
 		 869 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3955  DNA topoisomerase III  33.38 
 
 		 1002 aa  299  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4713  DNA topoisomerase III  32.29 
 
 		 992 aa  299  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000244341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0146  DNA topoisomerase III  32.81 
 
 		 869 aa  300  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2348  DNA topoisomerase III  32.81 
 
 		 869 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2810  DNA topoisomerase III  32.81 
 
 		 869 aa  299  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2998  DNA topoisomerase III  31.88 
 
 		 939 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.535221  normal  0.170765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6109  DNA topoisomerase III  31.08 
 
 		 867 aa  299  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0474  DNA topoisomerase III  33.57 
 
 		 729 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  32.76 
 
 		 680 aa  298  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3412  DNA topoisomerase III  32.86 
 
 		 896 aa  298  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  32.73 
 
 		 799 aa  297  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3339  DNA topoisomerase III  32.9 
 
 		 981 aa  297  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0884  DNA topoisomerase III  31.93 
 
 		 975 aa  296  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0066  DNA topoisomerase III  33.19 
 
 		 877 aa  296  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2289  DNA topoisomerase III  32.05 
 
 		 768 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0099  DNA topoisomerase III  32.1 
 
 		 854 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3990  DNA topoisomerase III  32.75 
 
 		 981 aa  295  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.250381  normal  0.105693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0431  DNA topoisomerase III  32.87 
 
 		 729 aa  295  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128239  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3683  DNA topoisomerase III  33.05 
 
 		 876 aa  294  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3360  DNA topoisomerase III  32.19 
 
 		 876 aa  293  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.96718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3963  DNA topoisomerase III  32.67 
 
 		 990 aa  292  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.107223  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1836  DNA topoisomerase III  32.31 
 
 		 711 aa  291  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000886336  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1780  DNA topoisomerase III  33.61 
 
 		 920 aa  290  9e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.778999 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2081  DNA topoisomerase III  33 
 
 		 876 aa  288  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.795726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0272  DNA topoisomerase III  34.24 
 
 		 707 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.369574 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0401  DNA topoisomerase  32.53 
 
 		 851 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0152197  decreased coverage  0.0000578583 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0396  DNA topoisomerase III  33.67 
 
 		 846 aa  287  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3021  DNA topoisomerase  32.83 
 
 		 689 aa  287  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2044  DNA topoisomerase type IA central domain protein  32.34 
 
 		 608 aa  287  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00726991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1341  DNA topoisomerase III  33.93 
 
 		 712 aa  287  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  31.2 
 
 		 730 aa  286  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0104  DNA topoisomerase III  32.93 
 
 		 675 aa  285  3.0000000000000004e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000375285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0018  DNA topoisomerase III  31.93 
 
 		 839 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  31.49 
 
 		 744 aa  285  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5202  DNA topoisomerase III  31.99 
 
 		 980 aa  284  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0265  DNA topoisomerase III  31.8 
 
 		 879 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.948213  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3295  DNA topoisomerase III  31.85 
 
 		 655 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3177  DNA topoisomerase III  31.15 
 
 		 920 aa  282  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.272894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2923  DNA topoisomerase III  32.19 
 
 		 654 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  30.72 
 
 		 676 aa  277  5e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0618  DNA topoisomerase III  31.09 
 
 		 669 aa  276  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1803  DNA topoisomerase III  30.16 
 
 		 754 aa  276  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1822  DNA topoisomerase type IA central domain protein  34.36 
 
 		 573 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  30.61 
 
 		 655 aa  275  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0229  DNA topoisomerase III  30.54 
 
 		 876 aa  274  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00108901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  32.07 
 
 		 670 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  31.78 
 
 		 670 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  31.91 
 
 		 670 aa  272  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  31.77 
 
 		 670 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  31.37 
 
 		 670 aa  271  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  31.52 
 
 		 666 aa  270  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0310  DNA topoisomerase III  29.96 
 
 		 679 aa  269  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  30.91 
 
 		 676 aa  270  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  30.91 
 
 		 676 aa  270  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4107  DNA topoisomerase III  30.01 
 
 		 679 aa  269  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0727596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0283  DNA topoisomerase III  30.28 
 
 		 684 aa  267  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>