More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2215 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2215  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 362 aa  678    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.645202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  43.81 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 739 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  34.91 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  38.84 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2417  glycosyl transferase group 1  43.48 
 
 		 373 aa  99.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.96 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  40.85 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  27.83 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 		 750 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 364 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3413  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  30.41 
 
 		 342 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 364 aa  96.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 409 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  46.34 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  40.61 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  39.29 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 		 377 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 376 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 704 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  42.35 
 
 		 414 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  32.29 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 		 413 aa  93.2  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 377 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 403 aa  92.8  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  31.62 
 
 		 370 aa  92.8  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  39.49 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  36.65 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  37.02 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.22 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2026  putative glycosyl transferase  45.03 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 689 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  37.9 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 364 aa  90.1  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 406 aa  90.1  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 362 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  35.1 
 
 		 503 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 364 aa  89.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 		 399 aa  89.4  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 379 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  29.17 
 
 		 803 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 		 812 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  42.08 
 
 		 379 aa  87  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 		 392 aa  86.7  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  40.24 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 816 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1918  glycosyl transferase, group 1  44.08 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  40.87 
 
 		 638 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  34.01 
 
 		 385 aa  85.9  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.98 
 
 		 391 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 383 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  42.14 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  31.36 
 
 		 816 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  31.75 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3566  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 871 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0942  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 1080 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>