More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2563 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2563  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 281 aa  569  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  48.36 
 
 		 511 aa  281  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.25 
 
 		 493 aa  259  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.57 
 
 		 487 aa  250  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6197  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.59 
 
 		 514 aa  246  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.327318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.96 
 
 		 501 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_002950  PG0069  hypothetical protein  45.71 
 
 		 504 aa  223  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  45.86 
 
 		 499 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0510  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0209732  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.77 
 
 		 521 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.64 
 
 		 533 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.72 
 
 		 515 aa  165  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  37.01 
 
 		 514 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.7 
 
 		 510 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  36.2 
 
 		 517 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.63 
 
 		 492 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.68 
 
 		 533 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.43 
 
 		 516 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35 
 
 		 519 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  36.46 
 
 		 519 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.76 
 
 		 524 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.13 
 
 		 525 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  38.1 
 
 		 522 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  36.67 
 
 		 499 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.27 
 
 		 520 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.38 
 
 		 514 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  36.19 
 
 		 499 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.04 
 
 		 524 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.89 
 
 		 521 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.92 
 
 		 524 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.91 
 
 		 494 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.32 
 
 		 494 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.1 
 
 		 533 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.55 
 
 		 494 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.55 
 
 		 494 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  36.03 
 
 		 499 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.86 
 
 		 511 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.51 
 
 		 499 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.29 
 
 		 498 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.8 
 
 		 499 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.91 
 
 		 499 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.91 
 
 		 499 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  31.49 
 
 		 513 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.91 
 
 		 499 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.93 
 
 		 500 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.88 
 
 		 521 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 516 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.2 
 
 		 517 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.34 
 
 		 492 aa  136  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 		 509 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.07 
 
 		 511 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  35.27 
 
 		 494 aa  135  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.02 
 
 		 530 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.7 
 
 		 524 aa  132  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.15 
 
 		 519 aa  132  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  34.36 
 
 		 498 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  34.22 
 
 		 492 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.59 
 
 		 530 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.34 
 
 		 506 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  34.12 
 
 		 496 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.97 
 
 		 502 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  31.23 
 
 		 512 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1317  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.04 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.57 
 
 		 504 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  34.5 
 
 		 488 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  34.19 
 
 		 506 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  34.5 
 
 		 486 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  34.9 
 
 		 492 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  33.73 
 
 		 524 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.41 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.22 
 
 		 518 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.54 
 
 		 499 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.89 
 
 		 502 aa  122  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  31.97 
 
 		 510 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.03 
 
 		 532 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.68 
 
 		 514 aa  122  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  31.73 
 
 		 515 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.73 
 
 		 515 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  31.73 
 
 		 515 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  31.73 
 
 		 515 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  31.73 
 
 		 515 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  31.73 
 
 		 510 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  31.73 
 
 		 510 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  31.73 
 
 		 515 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.42 
 
 		 479 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.39 
 
 		 546 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.46 
 
 		 513 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.43 
 
 		 504 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  36.55 
 
 		 502 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.1 
 
 		 494 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  32.57 
 
 		 514 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  32.57 
 
 		 514 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  32.57 
 
 		 514 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  32.57 
 
 		 514 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  33.88 
 
 		 496 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  32.57 
 
 		 514 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  32.97 
 
 		 512 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1232  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.01 
 
 		 496 aa  119  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271029  normal  0.25171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.08 
 
 		 529 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>