More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0866 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0866  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.787606  normal  0.897241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 397 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  28.24 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 272 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.4 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  30.54 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.01 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  29.08 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.16 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.09 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.41 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.55 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  24.87 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  27.37 
 
 		 271 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  24.37 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  28.77 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  26.54 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  29 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  29.27 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.48 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  25.94 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  24.79 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3424  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  45.21 
 
 		 110 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 298 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  27.17 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  26 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.69 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  28.4 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4750  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 340 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4836  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  28.27 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  26.75 
 
 		 340 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.38 
 
 		 265 aa  52.4  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  27.08 
 
 		 268 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 312 aa  52.4  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 301 aa  52.4  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.26 
 
 		 296 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 269 aa  52  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 281 aa  52  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 393 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  29.38 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 301 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 265 aa  51.6  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  26.01 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  25.71 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  27.32 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  28.04 
 
 		 396 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>