258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1467 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1467  sensor protein  100 
 
 		 537 aa  1048    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.186539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 		 1119 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4551  putative sensor with HAMP domain  32.98 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4502  putative sensor with HAMP domain protein  32.98 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.89 
 
 		 680 aa  57.4  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 569 aa  57.4  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00916  methyl-accepting chemotaxis protein  34.23 
 
 		 548 aa  57  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4183  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 		 516 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 		 640 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0276  putative sensor with HAMP domain protein  37.5 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0276  putative sensor with HAMP domain  37.5 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.529907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0878  histidine kinase, HAMP protein  37.04 
 
 		 394 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0214  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.51 
 
 		 816 aa  55.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 1268 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.1 
 
 		 519 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 		 1058 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  37.36 
 
 		 513 aa  54.3  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.77 
 
 		 660 aa  54.3  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 660 aa  54.3  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 640 aa  53.9  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.56 
 
 		 512 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000106495  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0527  putative sensor with HAMP domain protein  34.65 
 
 		 313 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.13 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.330959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 		 621 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.650368  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2607  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  34.15 
 
 		 741 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0695  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 		 561 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.305861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2477  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.96 
 
 		 617 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  35.53 
 
 		 660 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 		 628 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0729  PAS  30.84 
 
 		 945 aa  52  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0635035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 		 559 aa  52  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 628 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.608397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.53 
 
 		 660 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 513 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1651  histidine kinase, HAMP region  34.62 
 
 		 271 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0971523  normal  0.929646 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  35.53 
 
 		 660 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0349  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 		 695 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0100327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.95 
 
 		 550 aa  51.2  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4893  methyl-accepting chemotaxis protein I  30.21 
 
 		 551 aa  50.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 		 658 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  30.21 
 
 		 554 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  30.21 
 
 		 557 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  30.21 
 
 		 554 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979291 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  30.21 
 
 		 551 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  30.21 
 
 		 551 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 		 506 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2399  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44 
 
 		 392 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.17157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 618 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  22.11 
 
 		 1130 aa  50.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.9 
 
 		 660 aa  50.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3571  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 		 528 aa  50.4  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1143  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 541 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 639 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 585 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 		 537 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000862286  decreased coverage  0.00394801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 674 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 629 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 		 563 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  30.39 
 
 		 660 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 639 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 674 aa  49.3  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 623 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 551 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 554 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.51 
 
 		 823 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  34.72 
 
 		 658 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0085  sensor protein  28.87 
 
 		 300 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00149715  normal  0.0726608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2364  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  39.73 
 
 		 702 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 		 510 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 459 aa  48.5  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 		 630 aa  48.9  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  29.17 
 
 		 554 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 466 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 753 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 593 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 		 658 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 		 654 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1011  two component signal transduction sensor  45 
 
 		 737 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.880836  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 523 aa  48.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  30.39 
 
 		 660 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  32.5 
 
 		 660 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  32.5 
 
 		 660 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  32.5 
 
 		 660 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.24 
 
 		 538 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.307637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  32.5 
 
 		 660 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1881  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 		 592 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  37.21 
 
 		 1142 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.47 
 
 		 807 aa  47.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.87 
 
 		 661 aa  47.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  32.5 
 
 		 660 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 518 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 411 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0232938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1685  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.68 
 
 		 524 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3437  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 		 646 aa  47.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 		 578 aa  47.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00718884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0769  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 		 505 aa  47.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0409416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.56 
 
 		 646 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0815522  normal  0.369158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  37.21 
 
 		 1142 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.380177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>