More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3139 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3139  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797456  normal  0.0139946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0436  hypothetical protein  63.06 
 
 		 337 aa  427  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1121  hypothetical protein  55.45 
 
 		 330 aa  362  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2351  hypothetical protein  54.91 
 
 		 339 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1758  hypothetical protein  54.18 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6250  hypothetical protein  54.24 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2488  hypothetical protein  52.16 
 
 		 333 aa  315  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.572284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3141  hypothetical protein  52.47 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0038  hypothetical protein  52.07 
 
 		 327 aa  310  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.425396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.83 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.8 
 
 		 341 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.2 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.33 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.98 
 
 		 328 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  37.12 
 
 		 334 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  38.44 
 
 		 330 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.76 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.58 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.97 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.97 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  36.45 
 
 		 326 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.88 
 
 		 358 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.12 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  37.42 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.03 
 
 		 324 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.84 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  37.04 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  35.94 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.15 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  38.44 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.53 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.64 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.64 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.18 
 
 		 327 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.18 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  38.78 
 
 		 335 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  36.62 
 
 		 327 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.44 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.01 
 
 		 328 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  38.55 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.06 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.62 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.19 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.67 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  34.78 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2751  hypothetical protein  38.38 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  35.91 
 
 		 322 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.19 
 
 		 356 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  37.88 
 
 		 330 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  38.31 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  36.25 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.46 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  38.15 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.51 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.05 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  35.94 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.12 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  36.53 
 
 		 352 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  37.46 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  36.83 
 
 		 351 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  37.21 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.97 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  35.81 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  35.95 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  36.7 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  35.74 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  40.2 
 
 		 324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  37.33 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.62 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  37.77 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  35.16 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  37.77 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  35.41 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  36.75 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  35.4 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.85 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  36.45 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  37.63 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  38.64 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0797  hypothetical protein  38.33 
 
 		 318 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  34.86 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  36.64 
 
 		 331 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.35 
 
 		 331 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.28 
 
 		 336 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  36.06 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  36.61 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1909  hypothetical protein  37.88 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  37.76 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  37.82 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  34.29 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  36.49 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.38 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  37.5 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.27 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.92 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  35.94 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.65 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  34.35 
 
 		 327 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.17 
 
 		 344 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0621  hypothetical protein  38.39 
 
 		 357 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>