More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3141 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3141  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  657    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2488  hypothetical protein  97.9 
 
 
333 aa  628  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.572284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2351  hypothetical protein  53.07 
 
 
339 aa  332  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3139  hypothetical protein  54.42 
 
 
327 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797456  normal  0.0139946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1758  hypothetical protein  51.23 
 
 
328 aa  322  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1121  hypothetical protein  49.55 
 
 
330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0436  hypothetical protein  49.56 
 
 
337 aa  311  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6250  hypothetical protein  52.04 
 
 
329 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0038  hypothetical protein  45.31 
 
 
327 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.425396 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  41.18 
 
 
327 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  41.98 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  39.23 
 
 
322 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.31 
 
 
328 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.31 
 
 
328 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.55 
 
 
326 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.74 
 
 
339 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  38.18 
 
 
325 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  42.05 
 
 
341 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 
358 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  37.97 
 
 
339 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.48 
 
 
349 aa  222  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  40 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.53 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.12 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.2 
 
 
323 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.39 
 
 
324 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.04 
 
 
327 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.5 
 
 
328 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.69 
 
 
334 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  38.51 
 
 
322 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.62 
 
 
321 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.19 
 
 
328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.46 
 
 
336 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.62 
 
 
335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.84 
 
 
328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.06 
 
 
333 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  38.05 
 
 
359 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  38.79 
 
 
331 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  41.45 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0797  hypothetical protein  41.24 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  35.94 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.48 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.48 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.68 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.53 
 
 
344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  38.39 
 
 
343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.63 
 
 
331 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.05 
 
 
339 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  36.54 
 
 
322 aa  212  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.32 
 
 
330 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.32 
 
 
330 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.19 
 
 
337 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  35.95 
 
 
334 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.94 
 
 
339 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1909  hypothetical protein  41.61 
 
 
318 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.98 
 
 
327 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.99 
 
 
332 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.84 
 
 
330 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  43.35 
 
 
341 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.8 
 
 
304 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.5 
 
 
356 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.67 
 
 
335 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.5 
 
 
330 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  39.53 
 
 
323 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  38.02 
 
 
338 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.73 
 
 
322 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38.51 
 
 
331 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  41.9 
 
 
330 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  40.3 
 
 
330 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  34.95 
 
 
332 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  35.45 
 
 
334 aa  206  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.24 
 
 
331 aa  205  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  37.99 
 
 
330 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  36.61 
 
 
330 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  36.59 
 
 
339 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  37.71 
 
 
332 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.24 
 
 
331 aa  205  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  37.04 
 
 
341 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  37.84 
 
 
324 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  40.2 
 
 
323 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  40.14 
 
 
323 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  36.33 
 
 
331 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  36.45 
 
 
322 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  37.42 
 
 
331 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  40.06 
 
 
330 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  39.06 
 
 
336 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  37.37 
 
 
324 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.96 
 
 
328 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.68 
 
 
328 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.26 
 
 
320 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  37.39 
 
 
346 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  38.65 
 
 
322 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  35.96 
 
 
330 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  38.21 
 
 
327 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.15 
 
 
325 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  37.5 
 
 
328 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  35.38 
 
 
336 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  39.02 
 
 
335 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  38.93 
 
 
336 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0485  hypothetical protein  36.62 
 
 
333 aa  202  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>