More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1121 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1121  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  660    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1758  hypothetical protein  69.94 
 
 		 328 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2351  hypothetical protein  64.6 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0436  hypothetical protein  61.99 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6250  hypothetical protein  67.11 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3139  hypothetical protein  55.45 
 
 		 327 aa  362  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797456  normal  0.0139946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0038  hypothetical protein  57.29 
 
 		 327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.425396 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2488  hypothetical protein  51.05 
 
 		 333 aa  322  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.572284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3141  hypothetical protein  50.75 
 
 		 333 aa  322  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.82 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  42.91 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.95 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  39.87 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  39.94 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  39.88 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.53 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.45 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  41.09 
 
 		 343 aa  225  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.74 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  41.58 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.59 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  41.29 
 
 		 335 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.46 
 
 		 337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  40.36 
 
 		 335 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  40.66 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.89 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.08 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2751  hypothetical protein  42.23 
 
 		 339 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.94 
 
 		 339 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  40.3 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  41.46 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.83 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.51 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.83 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.06 
 
 		 331 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  37.23 
 
 		 327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  42.21 
 
 		 310 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.26 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  40.06 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.05 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.85 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.46 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.22 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  38.65 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.4 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.54 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.54 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  38.26 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  39.81 
 
 		 341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.91 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.65 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  38.2 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.45 
 
 		 326 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  37.22 
 
 		 322 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  40.47 
 
 		 332 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  38.49 
 
 		 360 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  38.41 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.72 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.31 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  36.73 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.38 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.5 
 
 		 332 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  36.67 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.86 
 
 		 349 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  39.06 
 
 		 312 aa  208  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.74 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.41 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  38.6 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.33 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  36.39 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  38.13 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.6 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  37.14 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  39.66 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.77 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.14 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.09 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  39 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.79 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.53 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  36.27 
 
 		 334 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.53 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.03 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.36 
 
 		 335 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  36.5 
 
 		 322 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  38.72 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  39.33 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  38.89 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  39.14 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  38.14 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  37.16 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.1 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  37.3 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  38.61 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  36.51 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  36.51 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.91 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0972  hypothetical protein  36.83 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000140362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  37.58 
 
 		 334 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.28 
 
 		 304 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>