More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2751 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2751  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  80.24 
 
 
334 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5038  extra-cytoplasmic solute receptor  48.31 
 
 
348 aa  292  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1019  hypothetical protein  47.21 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.89 
 
 
331 aa  255  8e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.89 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  42.47 
 
 
314 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.81 
 
 
328 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.81 
 
 
328 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.52 
 
 
335 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  42.47 
 
 
336 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  39.22 
 
 
351 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.3 
 
 
335 aa  235  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.84 
 
 
335 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  41.78 
 
 
335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.88 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.81 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6250  hypothetical protein  40.54 
 
 
329 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40.41 
 
 
330 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  40.27 
 
 
334 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.27 
 
 
334 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1121  hypothetical protein  42.23 
 
 
330 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.3 
 
 
338 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.73 
 
 
327 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  41.29 
 
 
338 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0436  hypothetical protein  39.1 
 
 
337 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  38.62 
 
 
323 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  40.27 
 
 
322 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.34 
 
 
339 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  44.41 
 
 
330 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  37.46 
 
 
338 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.95 
 
 
326 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  41.02 
 
 
325 aa  225  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1758  hypothetical protein  38.71 
 
 
328 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.89 
 
 
330 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.7 
 
 
333 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.89 
 
 
330 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  40.2 
 
 
336 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.75 
 
 
358 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  40.98 
 
 
474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  43.24 
 
 
330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.7 
 
 
356 aa  222  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  39.82 
 
 
332 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  40.41 
 
 
329 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  39.09 
 
 
329 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4453  hypothetical protein  39.66 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.43 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.29 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  38.46 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.24 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  39.25 
 
 
341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.83 
 
 
333 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  40.48 
 
 
335 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.89 
 
 
325 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.53 
 
 
328 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  41.36 
 
 
321 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  38.61 
 
 
339 aa  219  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.59 
 
 
330 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.59 
 
 
330 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  39.87 
 
 
326 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.85 
 
 
325 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  39.66 
 
 
317 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.1 
 
 
334 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.67 
 
 
332 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  35.99 
 
 
343 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  37.63 
 
 
324 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.59 
 
 
310 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  39.27 
 
 
330 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.46 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.66 
 
 
341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  41.36 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  38.31 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0797  hypothetical protein  42.09 
 
 
318 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.48 
 
 
339 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  39.32 
 
 
317 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  37.67 
 
 
329 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  43.05 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  39.73 
 
 
329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  40.82 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  38.69 
 
 
332 aa  215  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.21 
 
 
335 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.6 
 
 
337 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  38.02 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  35.35 
 
 
339 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  39.93 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  38.14 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.7 
 
 
327 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  38.7 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  39.12 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  39.12 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  39.93 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.56 
 
 
325 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  39.6 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.85 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.42 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  38.17 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  35.76 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2351  hypothetical protein  37.97 
 
 
339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3139  hypothetical protein  38.38 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797456  normal  0.0139946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>