More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0038 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0038  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  656    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.425396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2351  hypothetical protein  65.23 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1758  hypothetical protein  59.25 
 
 		 328 aa  359  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0436  hypothetical protein  56.89 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6250  hypothetical protein  57.63 
 
 		 329 aa  348  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1121  hypothetical protein  57.28 
 
 		 330 aa  340  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3139  hypothetical protein  52.07 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797456  normal  0.0139946 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2488  hypothetical protein  45.31 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.572284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3141  hypothetical protein  45.31 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  42.14 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  39.81 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.27 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.25 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.11 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.08 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  42.11 
 
 		 322 aa  222  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.38 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.4 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40 
 
 		 343 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  37.26 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.27 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  40.2 
 
 		 341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  36.45 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.65 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.14 
 
 		 337 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.2 
 
 		 328 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  36.68 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.1 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.52 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.52 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.51 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  37.74 
 
 		 332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  39.18 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.41 
 
 		 324 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  38.51 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  39.18 
 
 		 325 aa  211  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.5 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.89 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38.24 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  39.18 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  38.82 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  35.74 
 
 		 343 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  41.08 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  37.41 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.49 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  42.33 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  37.7 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.25 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  35.89 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  38.98 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  34.38 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  37.93 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  37.8 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  39.93 
 
 		 314 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  37.89 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  35.83 
 
 		 329 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.64 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  37.99 
 
 		 334 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  34.85 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.54 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  35.94 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  35.18 
 
 		 334 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.25 
 
 		 332 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.49 
 
 		 304 aa  205  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.13 
 
 		 325 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  39.87 
 
 		 327 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.95 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.81 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  37.46 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.75 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.34 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  37.3 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.32 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  35.97 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37.42 
 
 		 336 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  35.44 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  38.12 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.82 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  35.03 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.36 
 
 		 358 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.59 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.39 
 
 		 330 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  34.81 
 
 		 322 aa  202  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  35.4 
 
 		 323 aa  202  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  36.49 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  37.83 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  35.42 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  37.41 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.36 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.32 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.91 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  36.73 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.22 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  39.87 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0226  hypothetical protein  37.7 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.51 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  36.47 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>