126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2687 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



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Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2687  SCO1/SenC family protein  100 
 
 		 84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.121674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  59.52 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  60.98 
 
 		 197 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  51.85 
 
 		 188 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  54.76 
 
 		 203 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  54.76 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  50.62 
 
 		 202 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  52.38 
 
 		 207 aa  88.6  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  47.56 
 
 		 201 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  48.19 
 
 		 198 aa  87.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  48.78 
 
 		 202 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  48.78 
 
 		 223 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  46.34 
 
 		 201 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  48.78 
 
 		 223 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  50 
 
 		 210 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  45.12 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  53.57 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  47.62 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  48.24 
 
 		 196 aa  80.5  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  49.41 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  46.99 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  48.24 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  48.24 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  48.24 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  48.24 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  48.24 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  48.24 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  49.41 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  48.24 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  48.24 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  47.06 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  49.41 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  46.43 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  47.62 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  49.41 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  46.43 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  47.06 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  46.51 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  48.24 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  46.99 
 
 		 209 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  48.24 
 
 		 205 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  48.24 
 
 		 205 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  48.24 
 
 		 205 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  48.24 
 
 		 191 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  45.88 
 
 		 205 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  43.37 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  42.68 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  47.06 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  43.53 
 
 		 204 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  39.02 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  38.1 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  39.29 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  39.24 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  39.24 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  39.24 
 
 		 226 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  36.9 
 
 		 197 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  38.27 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  39.51 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  38.27 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  38.27 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  36.78 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  37.35 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  37.04 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  35.8 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  33.73 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  33.73 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  35.37 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 199 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  39.02 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  47.27 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  35.8 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  36.71 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  34.52 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  33.73 
 
 		 193 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  32.1 
 
 		 197 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  31.34 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  32.1 
 
 		 206 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  32.94 
 
 		 286 aa  47.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  25.61 
 
 		 220 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  36.47 
 
 		 203 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  30.95 
 
 		 204 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  31.71 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  30.59 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  34.12 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 215 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  35.62 
 
 		 215 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  28.05 
 
 		 208 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  31.03 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3024  electron transport protein SCO1/SenC  32.53 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  31.88 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  27.16 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
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NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  31.88 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
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NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  27.16 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
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