More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1110 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2391  oxidoreductase-like  86.03 
 
 
206 aa  319  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.569722  hitchhiker  0.00384612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1617  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 
229 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 
229 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 
239 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.712696  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2507  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.21 
 
 
238 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415229  normal  0.0198269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
230 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2089  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
238 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425137  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
233 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.143238  normal  0.918847 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
281 aa  85.5  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
306 aa  79  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
273 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 
249 aa  78.2  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.85 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl172  dehydrogenase  27.55 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  28.26 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  28.02 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0959  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17071  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily  28.97 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.267297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  33.89 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2666  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144956  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.43 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
264 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.37 
 
 
231 aa  72  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18610  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 
263 aa  72  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.56588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 
227 aa  72  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
269 aa  71.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2093  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  31.09 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.034658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2488  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  31.09 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000275641  hitchhiker  0.0000923684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.41 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252629  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.47 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80053  NADP(+)-dependent dehydrogenase acts on serine, L-allo-threonine, and other 3-hydroxy acids  25.51 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.248176  normal  0.05597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.32 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3160  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3022  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1270  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  31.52 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  28.8 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.97 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.9 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1010  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.02 
 
 
253 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3041  short chain dehydrogenase  31.52 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631041  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2026  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.35 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.293852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.79 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.78 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1872  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.07 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.105262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1164  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.79 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.581079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
293 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
274 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  0.0760952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.576341  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  26.21 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0334  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.81 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.08 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3021  short chain dehydrogenase  30.85 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.63 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294024 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  27.32 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.16 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.42 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4738  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.239273 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.72 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  29.38 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>