More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0469 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
251 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2916  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  56.57 
 
 
250 aa  285  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
250 aa  285  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58 
 
 
250 aa  275  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175795  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05398  oxidoreductase protein  56.4 
 
 
250 aa  268  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.979699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.6 
 
 
257 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.513752  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
259 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.719831  normal  0.512814 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7662  short-chain dehydrogenase  52.99 
 
 
250 aa  248  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1968  glucose/ribitol dehydrogenase  40.32 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140483 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
250 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0530041  hitchhiker  0.00231678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  40.24 
 
 
252 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
254 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
253 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
250 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
250 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1418  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.55 
 
 
248 aa  158  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000653973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2290  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.8 
 
 
249 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467056  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1939  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.76 
 
 
248 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.25 
 
 
250 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1626  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.04 
 
 
248 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000177661  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1629  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.04 
 
 
248 aa  155  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.5514199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2119  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.04 
 
 
248 aa  155  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000142813  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01498  L-allo-threonine dehydrogenase, NAD(P)-binding  39.04 
 
 
248 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000675994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
248 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000149507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0197  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.34 
 
 
254 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1748  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.04 
 
 
248 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124318  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2155  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.04 
 
 
248 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000180953  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1378  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.2 
 
 
248 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01509  hypothetical protein  39.04 
 
 
248 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000865743  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1701  3-hydroxy acid dehydrogenase  39.04 
 
 
248 aa  152  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649919  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1614  3-hydroxy acid dehydrogenase  40.4 
 
 
248 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
252 aa  151  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0691773  normal  0.0221679 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1682  3-hydroxy acid dehydrogenase  40.4 
 
 
248 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97667  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
256 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
248 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295991  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1826  3-hydroxy acid dehydrogenase  40.4 
 
 
248 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0315451  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1623  3-hydroxy acid dehydrogenase  40.4 
 
 
248 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1660  3-hydroxy acid dehydrogenase  40.4 
 
 
248 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00687336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1864  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.8 
 
 
249 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.612513  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1976  3-hydroxy acid dehydrogenase  38.8 
 
 
249 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
248 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
248 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0977  NADP-dependent l-serine/l-allo-threonine dehydrogenase ydfg  35.6 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.616956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1893  3-hydroxy acid dehydrogenase  37.7 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.29 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000194485  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
248 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
253 aa  145  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1944  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.4 
 
 
248 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.4 
 
 
248 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.964469  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2076  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.4 
 
 
248 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3251  putative short-chain dehydrogenase  40.4 
 
 
248 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3198  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.4 
 
 
248 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0832  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.4 
 
 
248 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2666  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.4 
 
 
248 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0971  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.94 
 
 
248 aa  144  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3915  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
248 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2050  3-hydroxy acid dehydrogenase  38 
 
 
249 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2130  3-hydroxy acid dehydrogenase  37.3 
 
 
249 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
248 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
267 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110488 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2351  3-hydroxy acid dehydrogenase  37.6 
 
 
249 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11526  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0730  oxidoreductase protein  39.42 
 
 
262 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
253 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
252 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0488  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.2 
 
 
253 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.596302  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.02 
 
 
254 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
253 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0602  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0114024  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  33.86 
 
 
257 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
256 aa  139  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
261 aa  138  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  33.86 
 
 
257 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
256 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565969  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1376  NADP-dependent l-serine/l-allo-threonine dehydrogenase ydfg  34.52 
 
 
250 aa  137  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
261 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
254 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.97 
 
 
239 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
254 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
254 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00671569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
250 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241835 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0920  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.47 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  37.3 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1181  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.67 
 
 
249 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
250 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2127  Serine 3-dehydrogenase  34.25 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.247906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>