83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3129 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3129  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  371  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.534094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  19.77 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  19.21 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0956  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  19.21 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  19.21 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  19.21 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  29 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.24 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  18.64 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  18.64 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  31.37 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  28.79 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  31.62 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.97 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  36.67 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  36.67 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.33 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0124  DNA-binding transcriptional repressor FabR  32.81 
 
 		 205 aa  42  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000427607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 212 aa  42  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 207 aa  42  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 226 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 249 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 228 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0139  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0390891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.33 
 
 		 213 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0657  TetR family transcriptional regulator  19.5 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.184165  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 228 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0230  DNA-binding transcriptional repressor FabR  32.81 
 
 		 205 aa  42  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220471  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 196 aa  42  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  28.87 
 
 		 199 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  34.78 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.67 
 
 		 218 aa  41.6  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 335 aa  41.6  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  26.71 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 209 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 209 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  27.63 
 
 		 199 aa  41.2  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 357 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  33.33 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 200 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 197 aa  41.2  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>