More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6209 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6209  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.74008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  53.56 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  54.81 
 
 		 254 aa  253  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 250 aa  238  9e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  51.68 
 
 		 251 aa  234  7e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  60.22 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  50.21 
 
 		 250 aa  231  8.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  49.79 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  48.13 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  49.58 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  49.58 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  49.16 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.03 
 
 		 655 aa  215  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  51.97 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  52.58 
 
 		 308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  51.53 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  47.08 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  51.08 
 
 		 253 aa  209  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  46.47 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  46.47 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  47.16 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  47.16 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  47.16 
 
 		 251 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  48.05 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  48.05 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  51.12 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  46.72 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  46.64 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  48.05 
 
 		 266 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1507  hypothetical protein  42.69 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.52 
 
 		 646 aa  205  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  49.37 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  46.69 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  50.47 
 
 		 251 aa  204  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  47.06 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  45.23 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  51.9 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  50.47 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  51.85 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  51.05 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  51.89 
 
 		 249 aa  201  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  48.84 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  50.7 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  45 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  46.84 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  50.71 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  51.58 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  50.47 
 
 		 251 aa  198  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  43.98 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  46.48 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  48.84 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  46.25 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  45.99 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  49.54 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  48.05 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  48.05 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  46.86 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  48.05 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  48.05 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  46.44 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  45.99 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  50.71 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  45.61 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  51.38 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  49.53 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  48.6 
 
 		 251 aa  194  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  46.72 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  48.84 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  49.31 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  47.06 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  45.42 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  43.98 
 
 		 250 aa  191  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  46.51 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  48.62 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  45.81 
 
 		 258 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  44.86 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  46.3 
 
 		 249 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  48.13 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 253 aa  187  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 		 263 aa  187  9e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  44.12 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  45.73 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  43.83 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.35 
 
 		 654 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 265 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0750  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  47.28 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  46.19 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0267  triosephosphate isomerase  48.83 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0238  triosephosphate isomerase  48.83 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  44.54 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  47.87 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>