197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2882 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2882  G3E family GTPase-like protein  100 
 
 		 318 aa  658    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000684528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  40.46 
 
 		 524 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3004  Protein of unknown function DUF1980  36 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0044  hypothetical protein  30.46 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0043  hypothetical protein  31.21 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0048  Protein of unknown function DUF1980  33.59 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3267  hypothetical protein  28.74 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.251894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1902  hypothetical protein  28.74 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00948912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  25.91 
 
 		 366 aa  67  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1905  hypothetical protein  28.74 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.060898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1868  hypothetical protein  28.74 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000275781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2052  hypothetical protein  28.74 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2085  hypothetical protein  28.74 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2042  hypothetical protein  28.16 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1858  hypothetical protein  28.74 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000233992  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  28.45 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  31.29 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2153  hypothetical protein  28.74 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0358578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2121  hypothetical protein  28.74 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.768081  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  28.45 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  28.85 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  26.42 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  30.63 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  28.42 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  29.3 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  27.87 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  23.78 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1541  hypothetical protein  28.74 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00136912  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  28.88 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  23.89 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  29.01 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  29.01 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  28.66 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  27.65 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  26.16 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  26.2 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  27.57 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  25.88 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  25.25 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  23.46 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  25.88 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  28.4 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  27.56 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  23.62 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  21.5 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  24.39 
 
 		 395 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  28.03 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  23.63 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.26 
 
 		 386 aa  53.1  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  26.26 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  23.94 
 
 		 364 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  27.32 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  27.33 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  23.93 
 
 		 367 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  23.86 
 
 		 379 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  27.1 
 
 		 338 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.26 
 
 		 390 aa  52.8  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  24.48 
 
 		 381 aa  52.8  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  23.24 
 
 		 470 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  27.04 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  21.24 
 
 		 408 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  21.03 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  22.7 
 
 		 419 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  25.82 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  22.8 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  23.93 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  26.9 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  22.29 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  22.87 
 
 		 382 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  25.68 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  22.84 
 
 		 362 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.56 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0337  Protein of unknown function DUF1980  20.71 
 
 		 268 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  22.7 
 
 		 375 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1417  hypothetical protein  21.86 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.450327  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4288  cobalamin synthesis protein, P47K  20.71 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  23.04 
 
 		 420 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  22.86 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  25.68 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  25.68 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  24.64 
 
 		 360 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  23.53 
 
 		 350 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  26.74 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  21.81 
 
 		 364 aa  49.3  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.74 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3487  cobalamin synthesis protein, P47K  21.86 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  23.76 
 
 		 394 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  24.12 
 
 		 353 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3251  cobalamin synthesis protein, P47K  23.26 
 
 		 290 aa  49.3  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.784399  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.74 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  23.91 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.68 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  21.46 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  21.58 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  21.54 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  23.31 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0580  putative GTP-binding protein YjiA  26.32 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.14 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.14 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  22.7 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>