More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2744 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 328 aa  648    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  49.69 
 
 		 338 aa  279  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  47.83 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  46.58 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  45.81 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  47.95 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  41.27 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  41.5 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  47.56 
 
 		 345 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  44.61 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  39.89 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  41.46 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  43.98 
 
 		 364 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  44.24 
 
 		 387 aa  245  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  42.06 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39 
 
 		 386 aa  242  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.84 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  37.94 
 
 		 395 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  36.07 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  42.25 
 
 		 407 aa  235  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  39.22 
 
 		 419 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  38.31 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  36.09 
 
 		 391 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  41.89 
 
 		 349 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  40.62 
 
 		 417 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  40.06 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  41.21 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  41.99 
 
 		 372 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0674  ATP/GTP binding protein  36.16 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  37.54 
 
 		 340 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  45 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  38.12 
 
 		 420 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  45.68 
 
 		 367 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  43.95 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  38.6 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  44.06 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  43.58 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  42.94 
 
 		 361 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.93 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.42 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  36.1 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.46 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.46 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  38.18 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  38.41 
 
 		 350 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.82 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  36.27 
 
 		 319 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  42.54 
 
 		 326 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  34.82 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.5 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  34.82 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.5 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  37.58 
 
 		 332 aa  195  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  36.05 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  38.46 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  35.84 
 
 		 350 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  35.91 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  37.89 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  35.82 
 
 		 347 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  36.81 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  35.26 
 
 		 353 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  36 
 
 		 350 aa  185  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  36.31 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  33.61 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  34.41 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.6 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  36.92 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  32.77 
 
 		 355 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.24 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  35.19 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.19 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  34.96 
 
 		 353 aa  179  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.83 
 
 		 335 aa  179  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  34.88 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  36.19 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  36.19 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  35.49 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  34.59 
 
 		 323 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  34.38 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  34.63 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.01 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  35.67 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04218  predicted GTPase  36.02 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3645  cobalamin synthesis protein P47K  36.34 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3714  putative GTP-binding protein YjiA  36.02 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4944  putative GTP-binding protein YjiA  36.02 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5864  putative GTP-binding protein YjiA  36.02 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4892  putative GTP-binding protein YjiA  36.02 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  34.84 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04184  hypothetical protein  36.02 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4884  putative GTP-binding protein YjiA  35.6 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  37.62 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0509  putative GTP-binding protein YjiA  36.14 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.47 
 
 		 357 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  34.2 
 
 		 352 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4943  putative GTP-binding protein YjiA  35.71 
 
 		 318 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.715992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  35.84 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4783  putative GTP-binding protein YjiA  35.71 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.120567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4936  putative GTP-binding protein YjiA  35.71 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.518194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4572  putative GTP-binding protein YjiA  36.42 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>