More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1229 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 
335 aa  678    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  47.48 
 
 
364 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  43.96 
 
 
334 aa  239  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  40.29 
 
 
382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  39.88 
 
 
382 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  41.64 
 
 
390 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  41.42 
 
 
387 aa  225  8e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.32 
 
 
386 aa  225  9e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  37.71 
 
 
391 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  46.69 
 
 
367 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.87 
 
 
390 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  38.17 
 
 
340 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  39.43 
 
 
366 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  39.88 
 
 
408 aa  219  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  45.35 
 
 
377 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  39.09 
 
 
372 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  36.84 
 
 
394 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  45.09 
 
 
366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  45.51 
 
 
375 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  39.94 
 
 
361 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  44.79 
 
 
366 aa  209  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  38.89 
 
 
419 aa  208  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  40.42 
 
 
407 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  34.45 
 
 
395 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  37.29 
 
 
377 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  38.18 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  36.76 
 
 
417 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.87 
 
 
335 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  40.51 
 
 
335 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  39.26 
 
 
470 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  37.13 
 
 
420 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  39.52 
 
 
337 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  39.34 
 
 
364 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  38.92 
 
 
349 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  35.33 
 
 
338 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  38.34 
 
 
331 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  36.59 
 
 
337 aa  185  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  34.62 
 
 
345 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  35.26 
 
 
350 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  36.12 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  35.71 
 
 
328 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  32.3 
 
 
353 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  35.03 
 
 
332 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.44 
 
 
323 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  33.53 
 
 
355 aa  169  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  31.84 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  35.94 
 
 
320 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.69 
 
 
326 aa  165  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.03 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.03 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  34.3 
 
 
350 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.03 
 
 
316 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  32.09 
 
 
350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  34.39 
 
 
316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.71 
 
 
319 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  35.03 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.81 
 
 
323 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.71 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  32.57 
 
 
364 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  33.83 
 
 
349 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.29 
 
 
320 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  34.71 
 
 
319 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.76 
 
 
316 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.08 
 
 
316 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  36.86 
 
 
322 aa  160  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  33.84 
 
 
335 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  34.85 
 
 
324 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  33.63 
 
 
350 aa  159  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.14 
 
 
320 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  34.69 
 
 
323 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  31.86 
 
 
352 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  32.77 
 
 
347 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  32.54 
 
 
351 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  32.48 
 
 
354 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  33.63 
 
 
347 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  32.85 
 
 
361 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.77 
 
 
337 aa  156  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.94 
 
 
345 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  44.27 
 
 
363 aa  155  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 
323 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  34.08 
 
 
319 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 
323 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  32.35 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  33.13 
 
 
329 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  34.34 
 
 
326 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  35.49 
 
 
328 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  35.49 
 
 
328 aa  152  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  30.7 
 
 
404 aa  152  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  43.23 
 
 
358 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  40.96 
 
 
395 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  33.94 
 
 
343 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  31.36 
 
 
369 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  40.96 
 
 
393 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  40.96 
 
 
359 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  41.8 
 
 
359 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  32.92 
 
 
323 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  40.43 
 
 
359 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  31.71 
 
 
365 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  31.45 
 
 
349 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  39.7 
 
 
452 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>