More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3457 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
322 aa  642    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  62.65 
 
 
324 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  63.81 
 
 
324 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  53.31 
 
 
323 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  50.32 
 
 
323 aa  328  8e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  50 
 
 
323 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  50.64 
 
 
323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  49.52 
 
 
323 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  49.52 
 
 
323 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  50.47 
 
 
335 aa  315  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  49.84 
 
 
326 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  45.85 
 
 
355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  48.26 
 
 
320 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  48.25 
 
 
332 aa  292  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  48.11 
 
 
329 aa  292  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  48.26 
 
 
328 aa  291  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  48.26 
 
 
328 aa  291  7e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  46.67 
 
 
320 aa  291  9e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.1 
 
 
345 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  43.66 
 
 
347 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  46.36 
 
 
343 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  43.66 
 
 
350 aa  287  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  42.9 
 
 
353 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  42.33 
 
 
355 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  43.23 
 
 
361 aa  285  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  42 
 
 
353 aa  285  7e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  43.57 
 
 
350 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  48.58 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  44.13 
 
 
363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  43.4 
 
 
349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  48.04 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  49.69 
 
 
327 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  41.16 
 
 
369 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  41.16 
 
 
367 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  43.97 
 
 
354 aa  277  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  43.1 
 
 
358 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  41.53 
 
 
360 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  40.83 
 
 
365 aa  276  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  46.73 
 
 
328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.71 
 
 
374 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  41.97 
 
 
364 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  43.65 
 
 
394 aa  269  5e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  40.06 
 
 
319 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.38 
 
 
319 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  42.46 
 
 
404 aa  257  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.38 
 
 
316 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.38 
 
 
316 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  40.69 
 
 
316 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.38 
 
 
316 aa  255  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.69 
 
 
316 aa  255  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.38 
 
 
316 aa  255  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.38 
 
 
316 aa  255  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  40.06 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  40.06 
 
 
316 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  40.12 
 
 
329 aa  245  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  41.64 
 
 
347 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  40.33 
 
 
375 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  41.09 
 
 
339 aa  230  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  40.63 
 
 
369 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  40.53 
 
 
343 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  38.11 
 
 
351 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  39.66 
 
 
360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  38.62 
 
 
349 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  38.14 
 
 
353 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  37.64 
 
 
350 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  38.04 
 
 
347 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  37.69 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  38.53 
 
 
352 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  38.07 
 
 
356 aa  218  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  36.04 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  46.67 
 
 
460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  36.93 
 
 
360 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  46.86 
 
 
460 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  45.64 
 
 
452 aa  215  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  46.25 
 
 
449 aa  215  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  46.25 
 
 
460 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  45.83 
 
 
449 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  47.08 
 
 
457 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  45.64 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  35.93 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  50.24 
 
 
493 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  35.28 
 
 
363 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  35.77 
 
 
362 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  50.7 
 
 
393 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  36.93 
 
 
352 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  35.59 
 
 
359 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  35.41 
 
 
387 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  35.18 
 
 
362 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  35.11 
 
 
393 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  34.92 
 
 
395 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  34.75 
 
 
359 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  35.11 
 
 
393 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  35.03 
 
 
388 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  36.29 
 
 
362 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  36.01 
 
 
362 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  34.88 
 
 
369 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  37.43 
 
 
357 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  34.59 
 
 
372 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3256  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.96 
 
 
358 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.96 
 
 
358 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>