More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5645 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 337 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  47.95 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  45.59 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  41.8 
 
 		 335 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.88 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  42.77 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  38.28 
 
 		 372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  41.9 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  41.34 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  38.06 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  37.82 
 
 		 382 aa  232  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  40.94 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.83 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  38.12 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.44 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  38.99 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  42.12 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  40.06 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  38.92 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  39.5 
 
 		 470 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  34.74 
 
 		 340 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  39.09 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  35.15 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  37.43 
 
 		 377 aa  208  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  33.07 
 
 		 391 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  35.82 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  41.35 
 
 		 366 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  35.69 
 
 		 419 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  38.18 
 
 		 361 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  33.59 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  40.9 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  39.94 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  39.53 
 
 		 367 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  36.59 
 
 		 335 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  35.8 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  35.47 
 
 		 407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  40.29 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  34.82 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  33.02 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.86 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  35.2 
 
 		 332 aa  179  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  32.83 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  32.79 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  32.83 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  32.94 
 
 		 420 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  32.75 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  31.87 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.86 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  35.35 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.11 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  33.23 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  32.69 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  33.11 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.46 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.11 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.72 
 
 		 319 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0674  ATP/GTP binding protein  30.23 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  34.43 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  33.93 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  34.94 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.8 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  34.25 
 
 		 323 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  30.84 
 
 		 319 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  33.84 
 
 		 325 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.06 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  32.92 
 
 		 323 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  34.78 
 
 		 323 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.44 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  34.27 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  30.43 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  32.1 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.85 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  32.41 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  33.54 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  36.05 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  35.62 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  29.69 
 
 		 364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.02 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04218  predicted GTPase  35.53 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3645  cobalamin synthesis protein P47K  35.85 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4892  putative GTP-binding protein YjiA  35.53 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3714  putative GTP-binding protein YjiA  35.53 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04184  hypothetical protein  35.53 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  33.64 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  30.95 
 
 		 404 aa  161  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5864  putative GTP-binding protein YjiA  35.53 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  33.75 
 
 		 327 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4878  putative GTP-binding protein YjiA  35.31 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  31.71 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4944  putative GTP-binding protein YjiA  35.53 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  32.92 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4572  putative GTP-binding protein YjiA  35.31 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  32.2 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  32.92 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.03 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  29.41 
 
 		 360 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  34.25 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  31.01 
 
 		 349 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  29.68 
 
 		 355 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  33.95 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>