More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0674 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0674  ATP/GTP binding protein  100 
 
 		 355 aa  730    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  36.16 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  34.18 
 
 		 331 aa  196  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  33.24 
 
 		 338 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  31.52 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  32.77 
 
 		 335 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.05 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  29.86 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  30.93 
 
 		 377 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  29.54 
 
 		 364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  31.63 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  30.35 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  28.22 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  29.41 
 
 		 366 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.44 
 
 		 316 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  31.16 
 
 		 364 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.44 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  34.11 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  34.03 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  29.77 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  32.55 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.11 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.11 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.12 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  29.79 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.12 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  31.09 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  33.12 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.8 
 
 		 316 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  32.7 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  33.22 
 
 		 329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  29.06 
 
 		 408 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0509  putative GTP-binding protein YjiA  35.06 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  32.34 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  29.47 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  30.48 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4783  putative GTP-binding protein YjiA  34.56 
 
 		 318 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.120567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4936  putative GTP-binding protein YjiA  34.56 
 
 		 318 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.518194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4884  putative GTP-binding protein YjiA  34.56 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4857  putative GTP-binding protein YjiA  34.56 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  28.13 
 
 		 407 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  35.76 
 
 		 350 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4943  putative GTP-binding protein YjiA  34.57 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.715992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  29.57 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  33.96 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  29.21 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04218  predicted GTPase  34.19 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4878  putative GTP-binding protein YjiA  34.19 
 
 		 318 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.48 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.44 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3714  putative GTP-binding protein YjiA  34.19 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04184  hypothetical protein  34.19 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4892  putative GTP-binding protein YjiA  34.19 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4572  putative GTP-binding protein YjiA  34.19 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4944  putative GTP-binding protein YjiA  34.19 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  32.96 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0962  putative GTP-binding protein YjiA  31.94 
 
 		 322 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.177818  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5864  putative GTP-binding protein YjiA  34.19 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0580  putative GTP-binding protein YjiA  34.75 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  28.04 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  32.04 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  30.27 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3645  cobalamin synthesis protein P47K  33.82 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  31.62 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  31.42 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  33.79 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  30.97 
 
 		 323 aa  140  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.15 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  32.39 
 
 		 366 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  28.69 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  31.34 
 
 		 328 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  31.97 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  28.69 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  29.91 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  32.37 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  30.95 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  31.99 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32.96 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  32.26 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  30.17 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  32.48 
 
 		 347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  34.16 
 
 		 324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  29.69 
 
 		 320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  27.66 
 
 		 364 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  31.94 
 
 		 377 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  32.88 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  32.29 
 
 		 326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  33.21 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  29.41 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  31.86 
 
 		 375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  30.25 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  30.25 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  29.32 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  30.43 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  32.38 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  41.1 
 
 		 352 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  29.69 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>