More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1883 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  98.42 
 
 
316 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
316 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  97.47 
 
 
316 aa  632  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  96.52 
 
 
316 aa  628  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  96.84 
 
 
316 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  95.89 
 
 
319 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  95.89 
 
 
316 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  95.57 
 
 
316 aa  624  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  95.89 
 
 
316 aa  622  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  95.57 
 
 
319 aa  622  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  90.82 
 
 
319 aa  597  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  50.63 
 
 
323 aa  318  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  48.28 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  46.39 
 
 
323 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  47.48 
 
 
323 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  47.48 
 
 
323 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  47.32 
 
 
323 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  44.02 
 
 
349 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  42.95 
 
 
320 aa  292  7e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  42.44 
 
 
350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  44.51 
 
 
328 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  42.52 
 
 
350 aa  286  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  42.01 
 
 
343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  42.82 
 
 
347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.11 
 
 
345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  46.06 
 
 
326 aa  282  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  44.97 
 
 
335 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  41.26 
 
 
361 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  41.19 
 
 
353 aa  279  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  41.79 
 
 
353 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  40.96 
 
 
355 aa  276  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  40.63 
 
 
350 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  42.86 
 
 
324 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  40.7 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  40.52 
 
 
351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  43.73 
 
 
404 aa  271  8.000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  39.33 
 
 
359 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  43.08 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  40.29 
 
 
355 aa  269  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  44.07 
 
 
394 aa  268  8e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  42.72 
 
 
320 aa  268  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  40.34 
 
 
363 aa  268  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  40.29 
 
 
352 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  43.04 
 
 
320 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  39.78 
 
 
358 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  44.03 
 
 
329 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  43.71 
 
 
328 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  43.71 
 
 
328 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  39.31 
 
 
349 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  39.28 
 
 
362 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  38.32 
 
 
384 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  38.42 
 
 
364 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  39.89 
 
 
359 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  40.11 
 
 
357 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  38.94 
 
 
362 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  40.13 
 
 
324 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  39.55 
 
 
362 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  39.44 
 
 
363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  38.53 
 
 
356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  37.85 
 
 
363 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  38.03 
 
 
359 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  38.14 
 
 
387 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  40 
 
 
354 aa  255  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  38.03 
 
 
388 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  37.85 
 
 
362 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  37.82 
 
 
393 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  38.5 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  39.03 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  38.03 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  37.54 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  41.72 
 
 
323 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  38.55 
 
 
367 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  37.61 
 
 
353 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  38.1 
 
 
365 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  41.27 
 
 
343 aa  249  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  40.3 
 
 
337 aa  248  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  41.32 
 
 
325 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  40.69 
 
 
322 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  41.4 
 
 
328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3256  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.46 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162964  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  37.14 
 
 
352 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0389  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.46 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.46 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338794  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3430  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.46 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0193  CobW/P47K family protein  37.46 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0205  CobW/P47K family protein  37.46 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2918  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.46 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0168  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.57 
 
 
357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  40.06 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  39.75 
 
 
334 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.19 
 
 
325 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  40.32 
 
 
328 aa  241  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  39.75 
 
 
325 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  39.75 
 
 
323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  39.75 
 
 
334 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  39.49 
 
 
320 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  38.87 
 
 
347 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0580  putative GTP-binding protein YjiA  41.27 
 
 
320 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.47 
 
 
374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  38.8 
 
 
325 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>