More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2088 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 364 aa  730    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  48.35 
 
 		 335 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  48.08 
 
 		 335 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  47.01 
 
 		 337 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  44.44 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  39.88 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  39.27 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  43.11 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  39.37 
 
 		 364 aa  222  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  40.22 
 
 		 377 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  37.16 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  38.95 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  38.99 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  37.6 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  39.26 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  37.04 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  34.84 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.11 
 
 		 390 aa  202  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.41 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  37.39 
 
 		 470 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  35.68 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  38.89 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  36.44 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  37.47 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  34.22 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  38.81 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  39.34 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  35.77 
 
 		 419 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  38.81 
 
 		 366 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  35.71 
 
 		 340 aa  186  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  38.55 
 
 		 375 aa  185  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  38.05 
 
 		 407 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  40.23 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  35.1 
 
 		 420 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  38.46 
 
 		 334 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  32.75 
 
 		 394 aa  171  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  38.1 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0674  ATP/GTP binding protein  29.54 
 
 		 355 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  32.95 
 
 		 350 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.04 
 
 		 320 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.3 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32.93 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.3 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  35.59 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  36.34 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.25 
 
 		 319 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  36.39 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.12 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0962  putative GTP-binding protein YjiA  35.95 
 
 		 322 aa  159  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.177818  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  33.23 
 
 		 404 aa  159  9e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.33 
 
 		 326 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  30.25 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.43 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  30.43 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.12 
 
 		 316 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  36.56 
 
 		 320 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  33.64 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  29.81 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  32.17 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  36.34 
 
 		 325 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  31.16 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  35.03 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  32.53 
 
 		 323 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  33.86 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  31.46 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  31.69 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  32.85 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  30.25 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  35.74 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  31.78 
 
 		 361 aa  152  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  32.54 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.94 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  31.58 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  29.2 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  30.99 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  31.88 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.72 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  31.36 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  30.2 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  31.11 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.72 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  30.88 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  30.17 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  31.23 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  42.25 
 
 		 460 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  42.93 
 
 		 460 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  30.99 
 
 		 350 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  30.7 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04218  predicted GTPase  34.53 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3714  putative GTP-binding protein YjiA  34.53 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  34.64 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4892  putative GTP-binding protein YjiA  34.53 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04184  hypothetical protein  34.53 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.43 
 
 		 337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  30 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4944  putative GTP-binding protein YjiA  34.53 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  30.55 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5864  putative GTP-binding protein YjiA  34.53 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  31.33 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>