More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1368 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 408 aa  809    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  68.72 
 
 		 387 aa  491  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  60.42 
 
 		 364 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  59.9 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  55.81 
 
 		 390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  57.18 
 
 		 382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  56.4 
 
 		 386 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  58.95 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  58.68 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  52.45 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  50.38 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  58.06 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  53.32 
 
 		 382 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  48.7 
 
 		 395 aa  352  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  61.39 
 
 		 367 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  58.47 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  50 
 
 		 366 aa  324  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  42.12 
 
 		 419 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  44.23 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  44.54 
 
 		 377 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  41.21 
 
 		 417 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  43.2 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  43.1 
 
 		 338 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  39.32 
 
 		 420 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  42.02 
 
 		 328 aa  253  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  41.24 
 
 		 335 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.36 
 
 		 335 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  41.26 
 
 		 337 aa  246  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  42.57 
 
 		 345 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  38.27 
 
 		 350 aa  242  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  41.36 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  41.16 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  37.61 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  41.04 
 
 		 335 aa  226  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  40.82 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  38.69 
 
 		 366 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  39.83 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  37.78 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  34.49 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  37.25 
 
 		 331 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  37.17 
 
 		 328 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  36.76 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  36.74 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.54 
 
 		 345 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  36.15 
 
 		 335 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  35.44 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  33.42 
 
 		 360 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  35.13 
 
 		 329 aa  186  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  33.78 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  36.66 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  36.39 
 
 		 357 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  36.49 
 
 		 353 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.8 
 
 		 326 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  36.47 
 
 		 320 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  37.01 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  34.89 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.24 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  34.56 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  35.88 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  34.56 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  36.72 
 
 		 350 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  35.33 
 
 		 332 aa  180  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  34.93 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  34.83 
 
 		 352 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  34.64 
 
 		 352 aa  177  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  34.19 
 
 		 355 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  36.03 
 
 		 353 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  31.34 
 
 		 393 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  31.5 
 
 		 365 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  36.16 
 
 		 349 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  34.59 
 
 		 323 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  34.25 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  35.13 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.14 
 
 		 323 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  32.28 
 
 		 364 aa  173  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  45.5 
 
 		 362 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  33.71 
 
 		 324 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  35.43 
 
 		 361 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  33.88 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  31.91 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  32.79 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  33.15 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  34.38 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.65 
 
 		 360 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  30.52 
 
 		 319 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  35.41 
 
 		 347 aa  169  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  33.96 
 
 		 339 aa  169  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  45.02 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  36.26 
 
 		 343 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  33.52 
 
 		 359 aa  167  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  33.05 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  34.15 
 
 		 356 aa  166  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  31.62 
 
 		 404 aa  166  8e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.17 
 
 		 337 aa  166  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  35.53 
 
 		 322 aa  166  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  34.38 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  37.9 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.03 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  37.87 
 
 		 326 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>