More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1926 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 390 aa  760    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  60.16 
 
 		 408 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  57.99 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  59.28 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  54.12 
 
 		 390 aa  388  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  55.26 
 
 		 382 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  54.69 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  55.47 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  58.2 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  57.38 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  48.45 
 
 		 391 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  48.59 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  47.29 
 
 		 395 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  57.45 
 
 		 377 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  58.18 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  47.77 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  50.55 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  47.35 
 
 		 377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  45.43 
 
 		 349 aa  279  8e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  44 
 
 		 419 aa  278  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  45.43 
 
 		 350 aa  276  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  43.18 
 
 		 470 aa  268  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  48.94 
 
 		 407 aa  265  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  43.79 
 
 		 417 aa  264  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  43.16 
 
 		 340 aa  258  9e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  43.4 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.24 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  43.99 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  42.06 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  38.9 
 
 		 420 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  43.92 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  43.63 
 
 		 366 aa  249  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  45.43 
 
 		 345 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  44.19 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  41.52 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  43.03 
 
 		 335 aa  232  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  41.59 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  38.95 
 
 		 364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  39.51 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  37.65 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  37.69 
 
 		 328 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  37.2 
 
 		 331 aa  192  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  37.09 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  36.9 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  35.56 
 
 		 355 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  35.65 
 
 		 394 aa  186  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  36.42 
 
 		 323 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  37.71 
 
 		 362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.47 
 
 		 326 aa  182  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  35.57 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.99 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  35.99 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  37.81 
 
 		 332 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  35.8 
 
 		 350 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  36.31 
 
 		 360 aa  179  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  35.59 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  35.39 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  35.82 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.96 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  37.18 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  36.29 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.29 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  34.5 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  32.97 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35.17 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.97 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  32.79 
 
 		 404 aa  172  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  35.05 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.44 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  31.93 
 
 		 360 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  30.95 
 
 		 316 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  34.13 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  35.41 
 
 		 353 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  34.6 
 
 		 352 aa  171  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  31.25 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  34.66 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  34.01 
 
 		 350 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.95 
 
 		 316 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  30.97 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  35.24 
 
 		 349 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.95 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.77 
 
 		 319 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  35.31 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.65 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  37.96 
 
 		 326 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  30.47 
 
 		 319 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.65 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  34.19 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.65 
 
 		 316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  35.31 
 
 		 320 aa  166  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  32.39 
 
 		 339 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  34.52 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  34.52 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  34.99 
 
 		 351 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  34.39 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  30.77 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  41.26 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  41.06 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  40.29 
 
 		 460 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  42.08 
 
 		 449 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>