More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1331 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 366 aa  733    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  43.63 
 
 		 390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.68 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.57 
 
 		 386 aa  235  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  43.1 
 
 		 364 aa  232  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  38.42 
 
 		 382 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  37.74 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  43.65 
 
 		 375 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  36.87 
 
 		 395 aa  215  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  44.51 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  35.29 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  37.36 
 
 		 408 aa  212  7e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  44.23 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  34.22 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  37.5 
 
 		 366 aa  205  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  37.25 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  42.74 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  35.54 
 
 		 470 aa  192  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  36.31 
 
 		 377 aa  192  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  34.11 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  42.02 
 
 		 367 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  35.45 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  36.12 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  34.5 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.42 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  35.28 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  35.55 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  35.47 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  34.78 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  34.65 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  35.21 
 
 		 334 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  35.26 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  32.75 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  35.8 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  30.89 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.31 
 
 		 320 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  34.83 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  35.75 
 
 		 360 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  34.94 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  33.53 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.9 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  34.49 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  33.61 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  33.42 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  34.02 
 
 		 320 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.8 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.79 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.79 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  34.51 
 
 		 354 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  32.33 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.01 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  32.43 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  33.84 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  33.43 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  33.42 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  32.42 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.03 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  29.2 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  33.62 
 
 		 360 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  34.05 
 
 		 358 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.2 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  32.43 
 
 		 353 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  29.2 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  30.79 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  30.18 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.2 
 
 		 316 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.32 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.32 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  33.67 
 
 		 328 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  28.4 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  28.74 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.4 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  30.77 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.32 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.45 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  30.43 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  32.05 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  31.04 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  32.66 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  30.63 
 
 		 363 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  29.33 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  32.84 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  29.8 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  32.84 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  28.45 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  31.28 
 
 		 364 aa  136  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  31.76 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0580  putative GTP-binding protein YjiA  32.05 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  40.43 
 
 		 359 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  29.92 
 
 		 384 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4884  putative GTP-binding protein YjiA  33.33 
 
 		 318 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  27.76 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4936  putative GTP-binding protein YjiA  33.33 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.518194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0674  ATP/GTP binding protein  30.49 
 
 		 355 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  39.64 
 
 		 369 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4943  putative GTP-binding protein YjiA  33.33 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.715992 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  30.75 
 
 		 404 aa  132  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  30.51 
 
 		 350 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>