More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11430 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  100 
 
 		 417 aa  828    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  57.58 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  52.15 
 
 		 420 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  54.27 
 
 		 407 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  53.76 
 
 		 377 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  42.18 
 
 		 366 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  41.62 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  42.78 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  43.13 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  39.73 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  42.12 
 
 		 338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  40.76 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  42.86 
 
 		 345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.42 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.87 
 
 		 386 aa  242  7.999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  42.21 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  38.21 
 
 		 391 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  41.62 
 
 		 364 aa  239  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  39.44 
 
 		 382 aa  235  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  43.01 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  37.37 
 
 		 394 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  40.87 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  40.56 
 
 		 328 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  43.16 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  42.56 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  42.44 
 
 		 375 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.79 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  35.41 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  38.42 
 
 		 470 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  41.5 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  41.23 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  40.06 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  41.21 
 
 		 367 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  41.93 
 
 		 361 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  39.71 
 
 		 331 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  36.76 
 
 		 335 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  37.28 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  35.6 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  32.23 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  34.02 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  35.69 
 
 		 351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  35.14 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  34.29 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  35.24 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  34.11 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  31.73 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  35.53 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  33.24 
 
 		 350 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  34.58 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.28 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  37.54 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.73 
 
 		 320 aa  167  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  32.85 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  32.66 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  32.85 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.49 
 
 		 357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35 
 
 		 325 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  33.04 
 
 		 394 aa  166  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.08 
 
 		 337 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  33.04 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  34.6 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  34.1 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  33.92 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  35.53 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  32.3 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  32.42 
 
 		 355 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  35 
 
 		 343 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  34.72 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 		 332 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  34.8 
 
 		 363 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32.26 
 
 		 323 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  34.2 
 
 		 350 aa  163  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  31.09 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  33.77 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  33.53 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  33.73 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  31.75 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  32.48 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  31.92 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  35.01 
 
 		 323 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  32.8 
 
 		 384 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  31.91 
 
 		 323 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  34.54 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.17 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  34.54 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.35 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  33.15 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  35.01 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  31.07 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.35 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 362 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  32.95 
 
 		 393 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  32.56 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  33.24 
 
 		 387 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  32.76 
 
 		 395 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  34.53 
 
 		 320 aa  156  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  39.9 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>