More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2015 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 353 aa  725    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  93.22 
 
 		 352 aa  624  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  67.97 
 
 		 362 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  68.8 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  67.96 
 
 		 359 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  67.51 
 
 		 357 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  66.67 
 
 		 363 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  61.83 
 
 		 384 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  67.32 
 
 		 362 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  62.61 
 
 		 351 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  63.19 
 
 		 363 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  62.67 
 
 		 359 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  61.76 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  61.86 
 
 		 349 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  64.33 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  65.92 
 
 		 387 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  62.43 
 
 		 362 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  64.25 
 
 		 393 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  64.04 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  64.44 
 
 		 395 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  61.13 
 
 		 352 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  62.15 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  63.97 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  64.61 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  60.22 
 
 		 372 aa  421  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  60.43 
 
 		 369 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  60 
 
 		 356 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0193  CobW/P47K family protein  62.64 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3256  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  62.64 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0389  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  62.64 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0168  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  64.79 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3430  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  62.64 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0205  CobW/P47K family protein  62.64 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  59.38 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  62.64 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338794  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2918  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  62.64 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  51.27 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  43.87 
 
 		 325 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  44.73 
 
 		 325 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  43.59 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  44.16 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  46.72 
 
 		 343 aa  281  9e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  43.64 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.43 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  43.8 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  43.54 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  43.5 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  44.57 
 
 		 334 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  46.32 
 
 		 374 aa  275  7e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  45.04 
 
 		 350 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  42.33 
 
 		 320 aa  275  7e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  43.47 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  44.57 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  42.74 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  43.14 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  45.01 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.01 
 
 		 345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  43.47 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  43.65 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  44.73 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  43.87 
 
 		 347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  42.57 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  42.57 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  45.14 
 
 		 353 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  44.59 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  44.07 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  44.23 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  42.09 
 
 		 323 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  41.03 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  41.88 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  42.35 
 
 		 328 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  42.17 
 
 		 323 aa  260  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  39.03 
 
 		 319 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  39.94 
 
 		 326 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  43.09 
 
 		 367 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  42.17 
 
 		 323 aa  259  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  42.02 
 
 		 404 aa  259  6e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  40.4 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  40.4 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  39.89 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  41.5 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0509  putative GTP-binding protein YjiA  41.14 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0580  putative GTP-binding protein YjiA  41.19 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  38.6 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  38.46 
 
 		 319 aa  252  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  41.88 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  41.12 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.18 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.89 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.89 
 
 		 316 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.18 
 
 		 316 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  37.89 
 
 		 316 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.18 
 
 		 316 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.32 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.61 
 
 		 316 aa  249  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4943  putative GTP-binding protein YjiA  40.74 
 
 		 318 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.715992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  43.47 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4783  putative GTP-binding protein YjiA  40.74 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.120567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4936  putative GTP-binding protein YjiA  40.74 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.518194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  42.42 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>